古代表觀遺傳改變沉默癌癥相關基因
Garvan醫(yī)學研究所領導的一項新研究表明,表觀遺傳變化是DNA控制的一種形式,它使人類發(fā)育晚期與癌癥相關的某些基因失活,已經(jīng)保存了4億多年。
研究人員發(fā)現(xiàn),人類某些癌癥中的基因也存在于斑馬魚中 - 但在受精后的幾個小時內(nèi)就會“沉默”。該研究揭示了我們的表觀遺傳學如何通過大的進化距離調(diào)節(jié)基因,其中一些基因與生命后期的癌癥發(fā)展有關。它還揭示了斑馬魚中的表觀基因組“重置自身”與人類胚胎之間的顯著差異,這可能指導未來對表觀遺傳的研究。
“我們已經(jīng)證明,我們已經(jīng)保存了這一胚胎事件,可以切斷與人類癌癥相關的基因,”負責這項研究的發(fā)育表觀基因組學實驗室負責人Ozren Bogdanovic博士說。“這很有趣,我們?nèi)匀徊恢浪鼮槭裁磿l(fā)生,但它表明對人類健康的重要性是讓這些基因保持沉默。”
乍一看,人類和斑馬魚(一種原產(chǎn)于南亞的小魚類)幾乎沒有相關性 - 事實上,我們共同的進化祖先可以追溯到4億多年前。
但在遺傳上,斑馬魚和人類并沒有那么不同 - 我們共享大約70%的蛋白質(zhì)生成基因。Garvan領導的團隊開始研究在胚胎發(fā)育過程中控制DNA如何“讀取”的表觀遺傳變化是多么保守。
基因部分受甲基化控制 - DNA標記“阻斷”基因被讀取。
研究人員首先從發(fā)育中的斑馬魚胚胎中分離出原始生殖細胞,即精子和卵子的前體細胞,并生成全基因組亞硫酸氫鹽測序(WGBS)數(shù)據(jù) - 這是細胞中所有DNA甲基化的快照。
斑馬魚基因組的父親形象
該團隊發(fā)現(xiàn)了哺乳動物和斑馬魚胚胎DNA甲基化的基本差異。
在人類中,當精子使卵子受精,然后再次逐漸甲基化時,這些DNA甲基化標簽大多是“清掃干凈”,以確保胚胎能夠正確發(fā)育。相反,斑馬魚胚胎保留了父親的甲基模式。
在這項研究中,研究人員發(fā)現(xiàn)斑馬魚的原始生殖細胞也不會重置其甲基化模式,而是繼承父系DNA甲基化模式。這與哺乳動物原始生殖細胞的發(fā)現(xiàn)形成對比,哺乳動物原始生殖細胞經(jīng)歷了第二次“清掃”DNA甲基化標簽。研究人員表示,這一發(fā)現(xiàn)揭示了種系發(fā)育的分子原理,并強調(diào)斑馬魚是一種有用的實驗模型,用于研究表觀遺傳特征如何在世世代代遺傳。
此外,研究人員在發(fā)育的四個階段篩選了斑馬魚胚胎中DNA是如何甲基化的。他們在受精后24小時內(nèi)發(fā)現(xiàn)了68個在甲基化過程中早期關閉的基因。
“有趣的是,大多數(shù)這些基因都屬于一種叫做癌癥 - 睪丸抗原的基因,”該研究的共同第一作者Ksenia Skvortsova博士說。“我們的研究表明,這些是斑馬魚和哺乳動物中首先被'沉默'或被DNA甲基化靶向的基因。”
對古老機制的新見解
編碼癌癥 - 睪丸抗原(簡稱CTA)的基因僅在雄性睪丸中有活性,但在人類的所有其他組織中都被關閉。由于未知原因,CTA基因在一些癌癥中再次開啟,例如黑素瘤。
“在開發(fā)胚胎時,哺乳動物和魚類的策略截然不同,”博格丹諾維奇博士說。“但是,盡管有這些非常不同的策略,但似乎CTA基因的控制在整個進化過程中都是保守的。”
雖然這項工作為我們的進化提供了新的視角,但它可能有可能影響人類健康的未來。針對CTA的藥物已經(jīng)被研究作為癌癥的潛在療法。目前的研究提供了更多證據(jù),證明了CTA的重要性,以及它們在進化過程中的嚴格控制程度。
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