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      從細菌細胞中分離質(zhì)粒DNA的自動化

      從細菌中分離質(zhì)粒DNA是一種重要的分子生物學方法,用于產(chǎn)生用于優(yōu)選下游反應的模板DNA。質(zhì)粒分離方法是基本的; 然而,高通量質(zhì)粒DNA提取一直具有挑戰(zhàn)性,存在諸如低產(chǎn)量和基因組DNA(gDNA)污染的問題。

      從細菌細胞中分離質(zhì)粒DNA的自動化

      一種自動化,高通量,基于多孔的質(zhì)粒提取技術(shù),其產(chǎn)量適合下游應用且不含gDNA,將大大有利于高通量實驗室,其中質(zhì)粒提取經(jīng)常成為瓶頸。

      96孔二氧化硅過濾板質(zhì)粒提取試劑盒可在市場上買到。在這些方法中,收獲細菌細胞并通過堿裂解裂解,消除細胞碎片,然后通過結(jié)合二氧化硅膜收集提取的DNA。隨后在洗脫純化的DNA之前洗滌膜。

      在本文中,耶拿描述了在SynbiCITE倫敦DNA鑄造開發(fā)出一種技術(shù),它使用CyBio ® FELIX移液平臺自動96孔,二氧化硅過濾板基于質(zhì)粒DNA提取協(xié)議。

      使用的CyBio ® FELIX移液平臺(圖1)使96個樣品,以在同一時間進行處理,在約1.5小時,用通用性同時處理大量的板。緊湊的平臺最大限度地減少了實驗室中自動質(zhì)粒分離系統(tǒng)所需的工作臺空間,并且與臺式離心機和機械臂一起,可以實現(xiàn)完全自動化的質(zhì)粒提取系統(tǒng)。使用該技術(shù),從細菌培養(yǎng)物中分離出平均產(chǎn)量為65ng /μL的質(zhì)粒DNA,樣品之間的變異性較低(±7.7ng /μLSD)和50μL的洗脫體積。質(zhì)粒DNA樣品也具有高質(zhì)量,適用于下游應用,如轉(zhuǎn)化或測序。

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