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      蘋果基因組序列有助于育種新品種的發(fā)表
      
			
      
				2019-06-18 09:35:29
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      本周的自然遺傳學(xué)由一個國際科學(xué)家團隊發(fā)表了一個高質(zhì)量的蘋果基因組序列，其中包括荷蘭瓦赫寧根大學(xué)和研究所的研究人員。該序列的出版有助于更快和更有針對性地培育具有增加的抗病性，改善的生產(chǎn)性狀和更好的果實品質(zhì)的新蘋果品種。有了這個，結(jié)果支持從環(huán)境和財務(wù)角度更可持續(xù)地生產(chǎn)蘋果果實。
      

      蘋果基因組序列有助于育種新品種的發(fā)表
      

      基因組序列由來自法國，意大利，德國，荷蘭和南非的國際研究機構(gòu)聯(lián)合組織?；蚪M數(shù)據(jù)的高質(zhì)量，表明超過4.2萬個推定的基因，是使用最新測序技術(shù)的結(jié)果，這些技術(shù)產(chǎn)生了長鏈DNA序列，非常特定的蘋果品種，以及蘋果開發(fā)的信息量最大的遺傳連鎖圖譜在早期的研究中。
      

      基因組序列為蘋果基因組的組織提供了新的見解。已經(jīng)通過RNA測序驗證了42,000個推定基因中的93%。這些知識可用于鑒定控制目標(biāo)性狀的基因，以及用于加速新品種育種的基于DNA的診斷測試的開發(fā)。
      

      使用所謂的二單倍體蘋果品種對本研究的成功至關(guān)重要。蘋果是一種異交物種，使其基因組雜合。此外，蘋果起源于兩個不同物種之間的雜交，其與全基因組復(fù)制相結(jié)合。因此，每種常規(guī)蘋果品種的每個DNA序列最多有四種變體。本研究中使用的二單倍體變種是特殊的，因為它每個序列只有兩個變體。這導(dǎo)致顯著的復(fù)雜性降低，這使得可以產(chǎn)生非常高質(zhì)量的基因組序列。
      

      蘋果基因組的新見解包括對蘋果17條染色體中重復(fù)模式的清晰認(rèn)識。這有助于鑒定具有類似功能的基因拷貝。接下來，組裝了所謂的“重復(fù)區(qū)域”。迄今為止，這些尚未表征的蘋果基因組區(qū)域可能參與調(diào)節(jié)基因表達。最后，發(fā)現(xiàn)了一種新的重復(fù)序列，可能對著絲粒特異，這可能會導(dǎo)致染色體分裂和復(fù)制的新見解。
      

      該研究由INRA-Angers的Etienne Bucher協(xié)調(diào)。瓦赫寧根大學(xué)和研究所的研究人員為基因組測序，基因組圖譜和裝配做出了貢獻，運用他們在生物信息學(xué)方面的經(jīng)驗和技能，并盡早獲得了蘋果中高質(zhì)量的參考遺傳連鎖圖譜。
      

      瓦赫寧根大學(xué)和研究所開發(fā)了新的蘋果品種，產(chǎn)生了頂級品種'Elstar'，'Santana'和最近發(fā)布的'Natyra'。后兩者適用于生物生產(chǎn)，因為這些品種具有抗病性。此外，'Santana'適合大多數(shù)患有輕微蘋果過敏的人食用。
      

      Wageningen將利用蘋果DNA中的新見解進行有針對性的新品種選育。
      
			

			
        
      
			
      
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