個體豬的蛋白質(zhì)特征使生產(chǎn)者能夠通過遺傳學(xué)確定肉的切割
歐盟的研究調(diào)查了個體豬的蛋白質(zhì)特征,因此生產(chǎn)者將能夠確定豬的遺傳性切割肉。通過基因組分析,在確定所有主要牲畜物種中基因組的可變性方面取得了相當(dāng)大的進展。然而,將基因組與其表型在肉質(zhì)和生產(chǎn)者類型方面聯(lián)系起來仍然具有挑戰(zhàn)性。
“組學(xué)”技術(shù)的進步為廣泛表現(xiàn)越來越多的個體收集提供了必要的工具。歐盟MarieSk?odowska-Curie個人獎學(xué)金援助項目MARKTHEPIG已應(yīng)用新興的現(xiàn)象學(xué)領(lǐng)域來合并來自組學(xué)技術(shù)的大量數(shù)據(jù)。表型組學(xué)是一門新興的跨學(xué)科,系統(tǒng)地研究細胞和生物體水平的全基因組表型表現(xiàn)。
MARKTHEPIG適用于高度表型的豬
正如MARKTHEPIG項目協(xié)調(diào)員Luca Fontanesi教授所解釋的那樣:“目前項目的目的是利用博洛尼亞大學(xué)在高度表型豬中獲得的知識,以更好地了解遺傳和非遺傳因素,這有助于動物的生產(chǎn)變異。“ 這些因素對設(shè)計該物種的選擇和育種策略具有重要影響。
MARKTHEPIG使用基于質(zhì)譜的蛋白質(zhì)組學(xué)來鑒定可能描述內(nèi)部或分子表型的新生物標(biāo)記物,以預(yù)測基因水平上動物的生產(chǎn)性能。此外,項目結(jié)果為使用表型組學(xué)開辟了新的可能性,以更好地將豬作為動物模型進行表征。
干腌火腿的分子基礎(chǔ)
動物新陳代謝的核心是它的肝臟。MARKTHEPIG首次描述了兩個重要豬品種在肝臟及其蛋白質(zhì)譜方面的分子差異。“總共捕獲并鑒定了大約500個蛋白質(zhì)組學(xué)斑點。其中25個導(dǎo)致在用于制備干腌火腿的兩個主要重型豬的豬的肝臟中表達差異,”Fontanesi教授概述道。
就火腿或培根的作用而言,研究小組發(fā)現(xiàn)了肝臟蛋白質(zhì)組學(xué)特征的差異,這可能間接地解釋了肌肉組織水平的差異。該項目的工作成果剛剛在同行評審期刊PLOS ONE上發(fā)表。
蛋白質(zhì)組學(xué)進展的挑戰(zhàn)和解決方案
為了實現(xiàn)該項目的目標(biāo),MARKTHEPIG進行了當(dāng)?shù)貙嶒炇覠o法支持的高級蛋白質(zhì)組學(xué)分析。作為一種解決方案,博洛尼亞大學(xué)的替代實驗室提供了蛋白質(zhì)組學(xué)方面的必要專業(yè)知識。
項目結(jié)束后,主機實驗室打算繼續(xù)進一步開發(fā)豬的分子表型。目標(biāo)是進一步描述品種內(nèi)和品種之間的遺傳變異。“這些年來我們收集的生物庫將為未來基于高通量分子表型技術(shù)的研究提供重要資源,”Fontanesi教授指出。
Fontanesi教授承認(rèn),居里個人研究員已經(jīng)通過添加其它分子表型的群體啟用豬的較大參考群體的形成豬已基因分型,并與許多另外的生物標(biāo)記表型。“該資源將成為許多其他研究的參考人群,這些研究對豬的育種和選擇部門以及基礎(chǔ)生物學(xué)具有潛在的高影響,”他總結(jié)道。
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