尋找一個(gè)城市的DNA 試試它的ATM

根據(jù)本周發(fā)表于美國(guó)微生物學(xué)會(huì)開(kāi)放獲取期刊mSphere的一項(xiàng)研究，紐約市的自動(dòng)取款機(jī)鍵盤(pán)有大量的微生物，但它們大部分來(lái)自正常的人類(lèi)皮膚，家庭表面或食物痕跡。“我們的研究結(jié)果表明，ATM鍵盤(pán)可以整合來(lái)自不同來(lái)源的微生物，包括人類(lèi)微生物組，食物以及適應(yīng)空氣或表面的潛在新環(huán)境生物，”高級(jí)研究作者，基因組學(xué)中心主任Jane M. Carlton博士說(shuō)。系統(tǒng)生物學(xué)，紐約大學(xué)生物學(xué)教授。“從ATM鍵盤(pán)獲得的DNA因此可以提供人類(lèi)行為和微生物環(huán)境來(lái)源的記錄。”

在研究過(guò)程中 - 2014年6月和7月研究人員在紐約市研究微生物的更大努力的一部分 - 調(diào)查人員在紐約三個(gè)紐約自治市：曼哈頓，皇后區(qū)和布魯克林的八個(gè)街區(qū)的66臺(tái)ATM機(jī)上擦了幾個(gè)鍵盤(pán)。其中四臺(tái)機(jī)器位于室外。然后，在實(shí)驗(yàn)室中，他們用16S擴(kuò)增子測(cè)序研究樣品，用于鑒定和比較細(xì)菌; 和18S擴(kuò)增子測(cè)序，用于鑒定寄生蟲(chóng)，真菌和原生生物(其他微觀(guān)生物)。大多數(shù)樣本中發(fā)現(xiàn)的最豐富的細(xì)菌是來(lái)自Actinobacteria，Bacteroides，F(xiàn)irmicutes和Proteobacteria的正常人類(lèi)皮膚微生物。家庭。總體而言，細(xì)菌樣本的多樣性較低，并且沒(méi)有明顯的地理聚類(lèi)。在18S測(cè)序中，研究人員發(fā)現(xiàn)了一些真菌和低水平的原生生物。

鍵盤(pán)上最常見(jiàn)的微生物來(lái)源是家用表面，如電視，洗手間，廚房和枕頭。研究人員發(fā)現(xiàn)了來(lái)自硬骨魚(yú)和軟體動(dòng)物的微生物，以及一些鄰近自動(dòng)取款機(jī)上的雞肉，這表明餐食殘留的DNA可能會(huì)留在人的手中，并在使用時(shí)轉(zhuǎn)移到ATM鍵盤(pán)上。

位于自助洗衣店和商店的ATM鍵盤(pán)具有最高數(shù)量的生物標(biāo)記物，其中最突出的是乳酸桿菌(乳酸菌)，其通常存在于分解植物或乳制品中。在曼哈頓的樣本中，研究人員觀(guān)察了生物標(biāo)志物Xeromyces bisporus，一種與變質(zhì)烘焙食品相關(guān)的食源性霉菌。“似乎有理由認(rèn)為這種真菌可能是從最近處理烘焙食品的人那里轉(zhuǎn)移出來(lái)的，特別是在曼哈頓中城等通勤密集的地區(qū)，附近有許多便利店和向商業(yè)工人出售這類(lèi)食品的咖啡館， “卡爾頓說(shuō)。

研究人員發(fā)現(xiàn)，在戶(hù)外與室內(nèi)ATM之間的鍵盤(pán)沒(méi)有顯著差異。

由于紐約市每個(gè)ATM鍵盤(pán)最有可能每天被數(shù)百人使用(并且可能與來(lái)自不同城市表面的空氣，水和微生物接觸)，因此本研究中獲得的微生物群落可能代表“平均”該研究的共同作者，紐約大學(xué)醫(yī)學(xué)院人類(lèi)微生物組計(jì)劃副教授Maria Gloria Dominguez-Bello博士說(shuō)，這個(gè)社區(qū)實(shí)際上匯集了來(lái)自不同來(lái)源的社區(qū)。

研究人員表示，地點(diǎn)之間相對(duì)缺乏多樣性可能是由于定期清理機(jī)器，這會(huì)消滅一些微生物，以及游客使用ATM，來(lái)自其他地方的通勤者等。接下來(lái)，他們將研究城市貓，狗，老鼠，鴿子和蟑螂中的微生物。

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