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      桃基因組為生物燃料作物的育種策略提供了見解
      
			
      
				2019-01-02 15:01:58
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			  來(lái)源：
			
      
		
      
				
		
      
			
      快速生長(zhǎng)的樹木如楊樹和柳樹是候選“生物燃料作物”，預(yù)計(jì)可以有效地提取纖維素乙醇和更高能量含量的燃料。對(duì)這些作物進(jìn)行馴化需要對(duì)樹木的生理學(xué)和遺傳學(xué)有深入的了解，科學(xué)家們正在轉(zhuǎn)向長(zhǎng)馴化的果樹以尋求提示。桃子和楊樹之間的關(guān)系乍一看可能并不明顯，但對(duì)于植物學(xué)家來(lái)說，兩棵樹都是玫瑰花超家族的一部分，其中不僅包括蘋果，草莓，櫻桃和杏仁等水果作物，還包括許多其他植物。包括玫瑰在內(nèi)的超級(jí)家族的名字。
      

      桃基因組為生物燃料作物的育種策略提供了見解
      

      美國(guó)能源部聯(lián)合基因組研究所(DOE JGI)工廠項(xiàng)目負(fù)責(zé)人，哈德遜阿爾法生物技術(shù)研究所的教員調(diào)查員Jeremy Schmutz說：“桃子和白楊樹之間的密切關(guān)系可以從他們的DNA序列中看出來(lái)。”
      

      在3月24日的Nature Genetics版本中，Schmutz和幾位同事參與了國(guó)際桃子基因組計(jì)劃(IPGI)，該計(jì)劃發(fā)布了Lovell品種Prunus persica的2.65億基礎(chǔ)基因組。
      

      “使用比較基因組學(xué)方法，桃子序列的表征不僅可以用于桃子和其他重要樹種的改良和可持續(xù)性，而且可以增強(qiáng)我們對(duì)樹木基本生物學(xué)的理解，”該團(tuán)隊(duì)寫道。他們將141個(gè)桃基因家族與其他6個(gè)完全測(cè)序的不同植物物種進(jìn)行了比較，以揭示獨(dú)特的代謝途徑，例如那些導(dǎo)致木質(zhì)素生物合成的途徑 - 將植物細(xì)胞固定在一起的分子“膠水” - 以及解構(gòu)的關(guān)鍵障礙生物質(zhì)轉(zhuǎn)化為燃料
      

      對(duì)于生物能源研究人員來(lái)說，桃子基因組的大小使其成為研究相關(guān)基因組中發(fā)現(xiàn)的基因的植物模型的理想選擇，例如白楊，美國(guó)能源部JGI的植物旗艦基因組之一，并開發(fā)用于提高生物燃料的植物生物量產(chǎn)量的方法。
      

      “我們感興趣的一個(gè)基因是桃子中所謂的”常綠“基因座，它延長(zhǎng)了生長(zhǎng)季節(jié)，”DOE JGI真核計(jì)劃負(fù)責(zé)人Daniel Rokhsar說道，他在2007年開始對(duì)桃子基因組進(jìn)行測(cè)序。“從理論上講，它可以在楊樹中進(jìn)行操作，以增加生物量的積累。“
      

      該出版物是在國(guó)際桃子基因組聯(lián)盟在DOE JGI工廠門戶網(wǎng)站Phytozome.net和其他網(wǎng)站上公開發(fā)布注釋桃基因組裝配草案三年后出版的。決定對(duì)桃基因組進(jìn)行測(cè)序是在2007年植物和動(dòng)物基因組XI會(huì)議期間首次公布的。
      
			

			
        
      
			
      
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