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      調(diào)查2014年埃博拉疫情的基因組起源
      
			
      
				2018-12-19 10:35:15
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      自今年3月以來，西非的埃博拉病毒感染并殺死了該地區(qū)數(shù)千人，引起了全世界的關(guān)注。世界衛(wèi)生組織表示，盡管進(jìn)行了治療和遏制措施，但這種流行病的死亡率依然高達(dá)驚人的52%。
      

      調(diào)查2014年埃博拉疫情的基因組起源
      

      埃博拉病毒是一種“人畜共患”疾病，意味著它在動(dòng)物和人類之間傳播，在這種情況下，從果蝠傳播到人類。一旦進(jìn)入人體，它很容易通過接觸血液和其他體液在人與人之間傳播。遏制措施復(fù)雜化，病毒的潛伏期很長：一個(gè)人可能在癥狀出現(xiàn)前最多感染21天。由于該地區(qū)長期的傳染性和衛(wèi)生條件差，這一流行病給醫(yī)護(hù)人員帶來了巨大的挑戰(zhàn)。
      

      但正如諺語所說，知識就是力量，更好地了解病毒是對抗埃博拉疫情的良好開端。這就是為什么馬薩諸塞州波士頓哈佛大學(xué)的研究科學(xué)家斯蒂芬·吉爾和他的同事們使用基因組測序技術(shù)來研究當(dāng)前爆發(fā)的起源，傳播和與其他爆發(fā)的關(guān)系。
      

      對于他們的研究，發(fā)表在8月28日的在線科學(xué)雜志上，Gire的研究小組對5月下旬至6月中旬在塞拉利昂的78名確診埃博拉病人的病毒DNA進(jìn)行了測序。對于這些患者中的13名，他們在多個(gè)時(shí)間點(diǎn)收集樣品，導(dǎo)致總共99個(gè)病毒基因組序列。他們將這些埃博拉病毒基因組相互比較，并將幾個(gè)來自幾內(nèi)亞的已發(fā)表的基因組與之前埃博拉病毒爆發(fā)產(chǎn)生的20個(gè)序列進(jìn)行了比較。
      

      基因組分析顯示，西非目前的病毒版本很可能在過去10年內(nèi)從中非傳播。他們還發(fā)現(xiàn)導(dǎo)致這次爆發(fā)的病毒和之前的兩種病毒在2004年左右與共同的祖先不同。這意味著這些爆發(fā)是從動(dòng)物水庫到人口的不同“跳躍”引起的。當(dāng)前爆發(fā)的樣本之間的相似性證實(shí)它起源于單次跳躍，并且從那時(shí)起疾病僅從人類傳播到人類。這與以前的爆發(fā)有所不同，之前爆發(fā)是通過多次人畜共患事件傳播的。
      

      作者的基因組檢測工作將塞拉利昂爆發(fā)的兩種遺傳上不同的病毒追溯到幾內(nèi)亞大約同一時(shí)間，可能是12名塞拉利昂病人參加了為死于該病毒的幾內(nèi)亞人舉行的葬禮。
      

      病毒DNA在受感染者的細(xì)胞中復(fù)制，缺乏人類和其他有機(jī)體中存在的“校對”機(jī)制，可檢測并糾正DNA復(fù)制過程中出現(xiàn)的錯(cuò)誤。缺乏校對機(jī)制導(dǎo)致DNA突變率高，使病毒快速進(jìn)化，適應(yīng)新環(huán)境并避免潛在的治療。通過比較在此次爆發(fā)期間分離的埃博拉基因組，該小組發(fā)現(xiàn)該病毒對DN??A序列的變化率很高，這改變了病毒蛋白的結(jié)構(gòu)或功能(非同義基因突變)。作者強(qiáng)調(diào)了快速嚴(yán)格控制病毒的必要性，因?yàn)檫@些突變可能使治療，識別和控制更加困難。
      

      為了推動(dòng)全球抗擊疫情的努力，Gire和他的同事已經(jīng)將基因組序列提供給其他研究人員使用。這將允許更徹底的流行病學(xué)研究，并希望使遏制努力更有效。
      

      不幸的是，該文件以悲慘的說法結(jié)束。在受影響地區(qū)工作期間，該論文的五位共同作者感染了該病毒并死亡。這種損失強(qiáng)調(diào)了研究爆發(fā)的重要性，以及那些愿意這樣做的人的勇敢和犧牲。
      

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