從內(nèi)到外研究癌癥表觀遺傳密碼可以告訴醫(yī)生疾病
接受癌癥診斷可能會(huì)失去對一切的控制。在這種診斷之后,患者,家人和朋友往往渴望獲得更多信息。它有侵略性嗎?提供什么治療?這些治療方法有效嗎?會(huì)傳播嗎?有時(shí)醫(yī)生可以提供答案,但在其他情況下,他們是難以捉摸的。如果沒有信息,患者可能會(huì)決定使用苛刻的藥物治療良性腫瘤或進(jìn)行危險(xiǎn)手術(shù),或者可能采取觀察性的方法治療侵襲性腫瘤 - 這兩種方法都不理想。
腫瘤如何相互不同 - 無論是在不同器官中還是在同一器官內(nèi) - 都可以提供有關(guān)預(yù)后和治療的有用線索。最終,這種知識(shí)可能導(dǎo)致精準(zhǔn)醫(yī)學(xué),醫(yī)生不僅要治療腫瘤,還要根據(jù)患者的特定腫瘤進(jìn)行治療。4月17日在線表觀遺傳學(xué)和染色質(zhì)在線發(fā)表的一項(xiàng)大規(guī)模的腫瘤新分析,正在使醫(yī)學(xué)更接近這些目標(biāo)。
像通往羅馬的所有道路一樣,細(xì)胞有很多通路可以變成癌癥。其中一條道路涉及細(xì)胞如何讀取表觀遺傳密碼,即位于人體DNA上的“其他遺傳密碼”。在每個(gè)細(xì)胞中,DNA被標(biāo)記為化學(xué)基團(tuán) - 如DNA上的標(biāo)志 - 構(gòu)成表觀遺傳密碼并充當(dāng)指南。這些標(biāo)志有助于細(xì)胞機(jī)器知道何時(shí)激活或滅活基因。在健康細(xì)胞中,正確放置這些標(biāo)記并以正確的比例表達(dá)基因。然而,在許多腫瘤細(xì)胞中,標(biāo)記被錯(cuò)誤地應(yīng)用。
當(dāng)極端數(shù)量的健康甲基化學(xué)基團(tuán)(如基因的開/關(guān)開關(guān))被錯(cuò)誤地添加到細(xì)胞DNA上的許多位置時(shí),就會(huì)發(fā)生一種不正確的DNA標(biāo)記。因此,這些新添加的甲基不是細(xì)胞與其天然生物學(xué)工作相結(jié)合,而是導(dǎo)致細(xì)胞表現(xiàn)不規(guī)律,導(dǎo)致細(xì)胞表達(dá)基因處于錯(cuò)誤的水平,或根本不表達(dá)。這通常會(huì)破壞小區(qū)中正常的信息流。重要的是,這些標(biāo)志可以關(guān)閉關(guān)鍵的防御基因,有助于保護(hù)細(xì)胞免于癌變和破壞其他過程。當(dāng)發(fā)生這種情況時(shí),它被稱為“CpG島甲基化表型”或簡稱CIMP。
“當(dāng)化學(xué)標(biāo)志不適當(dāng)?shù)胤旁诨蛏蠒r(shí),細(xì)胞就會(huì)失去其自然防御能力,從而導(dǎo)致像癌癥這樣的疾病,”Laura Elnitski博士說,他是轉(zhuǎn)化和功能基因組學(xué)分部的高級研究員。國家人類基因組研究所(NHGRI)。“在某種程度上,它就像失去對城市的控制 - 停車燈變得混亂,垃圾收集停止,速度限制在其他問題中被忽略。”
研究人員發(fā)現(xiàn),CIMP腫瘤與不同腫瘤類型的不同結(jié)局有關(guān)。例如,在乳腺癌中,CIMP與較低的惡性腫瘤風(fēng)險(xiǎn)和較高的存活機(jī)會(huì)相關(guān)。但前列腺癌也是如此,它可以表明更具侵襲性的癌癥。因此,患者的狀態(tài)可以幫助醫(yī)生更詳細(xì)地了解特定腫瘤和疾病進(jìn)展。
為了更好地對腫瘤進(jìn)行分組,醫(yī)生需要一種方法來分析CIMP的腫瘤,以找出“陽性”與“陰性”的患者。由Drs領(lǐng)導(dǎo)的團(tuán)隊(duì)。Elnitski和FranciscoSánchez-Vega是Elnitski博士實(shí)驗(yàn)室的前博士后研究員,他對來自15種不同癌癥類型的5,000多種腫瘤樣本以及近24種癌細(xì)胞系進(jìn)行了全面的CIMP分析。他們發(fā)現(xiàn)CIMP可以在幾乎所有類型的癌癥的子集中找到,并且表現(xiàn)出與正常樣本的極端差異。
從這數(shù)千個(gè)腫瘤中,可以使用超過8,000個(gè)DNA標(biāo)記來定義腫瘤中的CIMP。從這一點(diǎn)開始,他們將8,000個(gè)旗幟放入了一個(gè)僅有89個(gè)標(biāo)記的小型,強(qiáng)大的標(biāo)記中,這些標(biāo)記可以準(zhǔn)確地確定患者在至少12種腫瘤類型中的狀態(tài)。這些發(fā)現(xiàn)應(yīng)有助于進(jìn)一步對腫瘤進(jìn)行分類,為患者和從業(yè)者提供有價(jià)值的信息。它還可以使診斷和治療更接近精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)。
“近年來,CIMP已經(jīng)在多種器官的腫瘤中進(jìn)行了研究,所以我們現(xiàn)在知道很多腫瘤都有這種情況。這就是我們所說的”泛癌癥“現(xiàn)象,這意味著它是我們在許多類型的癌癥,“埃爾尼茨基博士說。“有了這套標(biāo)記,我們希望了解導(dǎo)致CIMP的原因,在分子水平上找出腫瘤中發(fā)生的情況,更重要的是,幫助臨床醫(yī)生指導(dǎo)對患者的護(hù)理,使他們不僅得到更好的護(hù)理,而且正確的護(hù)理。“
為了實(shí)現(xiàn)精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)的承諾 - 通過其有針對性的治療和治療 - 醫(yī)學(xué)科學(xué)必須能夠?qū)⒓膊》诸悶楦〉膩喗M。因此,癌癥診斷不會(huì)簡單地告訴患者癌癥的類型和位置,還會(huì)告訴患者特定癌癥的分子和表觀遺傳特征。有了這些信息,預(yù)后和治療都會(huì)變得更加精確。
從長遠(yuǎn)來看,這項(xiàng)CIMP研究可能有助于其他科學(xué)家揭示這一特定癌癥相關(guān)事件背后的遺傳機(jī)制。最終,這些機(jī)制可能被用作其他療法的目標(biāo)。在短期內(nèi),該研究為繼續(xù)研究CIMP提供了堅(jiān)實(shí)的基礎(chǔ),以及一組可用于創(chuàng)建臨床試驗(yàn)以確定CIMP腫瘤的標(biāo)記物。如果測試成功,醫(yī)生就會(huì)對這些癌癥有更好的臨床表現(xiàn)。這將使他們能夠更好地告訴患者擔(dān)心他們的癌癥,提供可能有助于患者感受更多控制的問題的答案。
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