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      ENCODE項目DNA元素的ENCyclopedia
      
			
      
				2018-12-15 15:04:21
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      國家人類基因組研究所(NHGRI)支持名為ENCODE的公共研究聯盟，即 Enc yclopedia O f D NA E lements，以識別人類和小鼠基因組中的所有功能元件。
      

      ENCODE項目DNA元素的ENCyclopedia
      

      ENCODE已經生成了大量數據，可以通過項目的可自由訪問的數據庫ENCODE Portal訪問。ENCODE“ Encyclopedia ”將這些數據組織成兩個注釋級別：1)綜合級注釋，包括候選順式調控元素的注冊表和2)直接從實驗數據中獲得的地面注釋。
      

      作為外展和協作的結果，ENCODE數據被廣泛使用?？梢栽贓NCODE門戶上找到使用ENCODE資源的出版物列表。(參見ENCODE資助的出版物和社區(qū)出版物。)ENCODE門戶網站還提供來自modENCODE的數據以及來自RoadMap Epigenomics和Gene Regulation of Gene Regulation項目的數據。有關數據標準和指南以及統一數據處理的其他信息也可以在ENCODE門戶網站上找到。
      

      ENCODE項目于2003年啟動，試驗階段的重點是人類基因組的1%，隨后完成了另外兩個階段(ENCODE 2和ENCODE 3)，這些階段對人類和小鼠基因組進行了全基因組分析。在modENCODE項目下，同時致力于秀麗隱桿線蟲和黑腹果蠅基因組的全基因組分析。鑒于需要采用新的方法，方法和技術來實現ENCODE的目標，NHGRI自2003年以來還資助了四輪技術開發(fā)計劃。其中一些努力已納入ENCODE數據生成和分析的后續(xù)階段。
      

      隨著ENCODE項目這三個階段的成功以及認識到需要額外的努力來完成和理解編制的候選監(jiān)管要素目錄，NHGRI于2017年2月資助了ENCODE(ENCODE 4)的第四階段以繼續(xù)并擴展它的工作是了解人類和小鼠的基因組。
      

      ENCODE 4旨在通過研究更廣泛多樣的生物樣本(包括與疾病相關的生物樣本)以及采用以前未在ENCODE中使用的新型分析來擴展人類和小鼠基因組中候選調控元件的目錄。為了最大限度地利用研究社區(qū)對ENCODE數據的訪問，所有數據都在沒有受控訪問的數據庫中共享。所有新獲得的人類生物樣品均同意不受限制的數據共享。為了研究ENCODE編制的候選調控元件的生物學功能，ENCODE 4中增加了一個新的功能元素表征組件。
      
			

			
        
      
			
      
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