研究人員對(duì)紅狐基因組進(jìn)行測(cè)序
一個(gè)國(guó)際科學(xué)家小組成功地對(duì)紅狐(Vulpes vulpes)的基因組進(jìn)行了測(cè)序。
家犬和紅狐是密切相關(guān)的物種,僅在大約1000萬(wàn)年前在犬科中分化。然而,這兩個(gè)物種占據(jù)了截然不同的生態(tài)位。
紅狐貍的地理范圍比食肉目中的任何其他野生物種都要寬,甚至已成為許多主要城市的常見(jiàn)居民。
另一方面,這只狗因?yàn)橐粋€(gè)不同的原因而變得普遍:它至少在15000年前被灰狼馴化而成為了人類最好的朋友。
“我們一直在等待這個(gè)工具很長(zhǎng)一段時(shí)間,”主要作者,伊利諾伊大學(xué)研究員Anna Kukekova博士說(shuō)。
“在我們之前的工作中,我們?cè)噲D找出負(fù)責(zé)馴服和攻擊性行為的狐貍基因組區(qū)域,但這些研究需要參考基因組,我們可以使用的只是狗基因組。對(duì)我們來(lái)說(shuō),狐貍基因組為行為的遺傳分析提供了更好的資源。“
在對(duì)狐貍基因組進(jìn)行測(cè)序和組裝后,Kukekova博士及其同事對(duì)來(lái)自馴服,侵略性和傳統(tǒng)農(nóng)場(chǎng)種群的一組狐貍進(jìn)行了測(cè)序,以確定與對(duì)行為選擇的反應(yīng)相關(guān)的基因組區(qū)域。
他們解碼了每個(gè)群體中10個(gè)個(gè)體的基因組,然后將它們與完整的狐貍基因組相互比較。
這三個(gè)種群在103個(gè)基因組區(qū)域存在差異,其中一些區(qū)域?qū)︸Z服和攻擊性行為負(fù)有責(zé)任。
“通過(guò)我們以前的工具,以這樣的分辨率找到基因組區(qū)域是出乎意料的,”Kukekova博士說(shuō)。
“現(xiàn)在,我們第一次不僅可以確定染色體的一部分,這使得狐貍更加馴服或具有侵略性,但我們可以找出對(duì)其負(fù)責(zé)的特定基因。”
研究人員將103個(gè)基因組區(qū)域與其他測(cè)序哺乳動(dòng)物區(qū)域進(jìn)行了比較,發(fā)現(xiàn)了一些令人信服的相似之處。
例如,他們確定了狐貍行為區(qū)域與狗馴化中重要區(qū)域之間的匹配,以及與人類中Williams-Beuren綜合征相關(guān)的區(qū)域,這是一種以非常外向,友好行為為特征的遺傳性疾病。
“奇怪的是,我們發(fā)現(xiàn)了威廉姆斯 - 比倫地區(qū)的侵略性狐貍,而不是馴服的狐貍。我們認(rèn)為這是相反的,“庫(kù)克科娃博士說(shuō)。
“這一神秘發(fā)現(xiàn)強(qiáng)調(diào)了在充分理解這些地區(qū)之前還需要進(jìn)行多少研究。”
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