美國馬里蘭州貝塞斯達， 2018年10月12日 - 美國國立衛(wèi)生研究院支持的計劃正在確定哪些基因和基因組變異在人類疾病中發(fā)揮作用，使其能夠用于基因組醫(yī)學和研究。美國國立衛(wèi)生研究院的臨床基因組資源(ClinGen)和ClinVar計劃解決了將基因組醫(yī)學納入醫(yī)療保健的一個主要障礙，這是缺乏基因變異與疾病之間關系的證據(jù)。10月12 日發(fā)表的一篇關于人類突變的特刊突出了通過這些計劃取得的廣泛進展，這些計劃協(xié)同工作以推進將人類基因組變異與人類健康聯(lián)系起來的知識。

國家人類基因組研究所(NHGRI)于2013年在Eunice Kennedy Shriver 國家兒童健康與人類發(fā)展研究所和國家癌癥研究所的支持下建立了ClinGen 。ClinGen的目標是匯集臨床和研究專家，以開發(fā)標準流程，以審查基因變異及其與健康和疾病的關系的數(shù)據(jù)。然后，這些專家確定每種變體對疾病診斷和治療的意義。有關基因變異的信息存儲在ClinVar中，由美國國立衛(wèi)生研究院的國家生物技術信息中心(國家醫(yī)學圖書館的一部分)資助和維護。

“通過ClinGen和ClinVar的工作，來自230個機構的730多名研究人員，臨床醫(yī)生和策展人一直在共同努力，以標準化與人類疾病有關的基因和基因組變異的評估，”Eric Green博士說道，他是博士， NHGRI主任。“最終，這些努力將改善基因組醫(yī)學的實施和更高質量的患者護理。”

提供證據(jù)

ClinGen研究人員開發(fā)了基因 - 疾病有效性框架，以評估基因變異在特定疾病中的作用。由來自世界各地的癌癥，神經(jīng)發(fā)育障礙和心血管疾病等疾病專家組成的臨床醫(yī)生和研究人員組成的14個基因治療專家小組正在實施這一框架。在特刊中，兩個專家小組報告了與癲癇和RAS病相關的基因; 后者是一組罕見的遺傳病，包括Noonan綜合征，Cardio-Facio-Cutaneous綜合征，Costello綜合征和Legius綜合征。癲癇的16個基因中的8個以及評估其對RAS病變的貢獻的20個基因中的6個沒有足夠的證據(jù)支持疾病中的作用。

ClinGen的研究人員還利用美國醫(yī)學遺傳學和基因組學學會以及分子病理學協(xié)會開發(fā)的指南來確定基因中導致疾病的那些特定變異和那些不導致疾病的變異。在四篇發(fā)表的論文中，ClinGen的Variant Curation專家小組概述了他們?nèi)绾味ㄖ浦改弦越鉀Q基因的獨特方面，包括聽力損失，CDH1(與胃癌和乳腺癌相關)，PAH(與苯丙酮尿癥相關)，和PTEN(與腫瘤綜合征有關)。臨床醫(yī)生可以使用ClinVar中可用的專家分類基因變體來確定他們在患者中遇到的變異是否會導致疾病。研究人員還可以選擇某些基因變異體在他們的實驗室進行研究。

“ClinGen和ClinVar是美國國立衛(wèi)生研究院的不同部分，校外研究界和來自世界各地的臨床檢測實驗室如何共同改進我們共享基因組信息并利用它來改善我們對DNA變異之間關系的理解的很好的例子。序列和疾病，“麻省理工學院麻省理工學院和波士頓麻省總醫(yī)院臨床基因組學家和ClinGen首席研究員Heidi L. Rehm博士說。Rehm博士，Jonathan S. Berg，醫(yī)學博士，北卡羅來納大學教堂山分校博士; 休斯頓貝勒醫(yī)學院醫(yī)學博士，Sharon Plon博士提供了這些課程的概述，并擔任25篇論文特刊的共同編輯。

ClinGen的研究人員還開發(fā)了一種評估二級發(fā)現(xiàn)的臨床可行性的方法，在這種情況下，即使他們不是診斷測試的最初焦點，在一個人身上發(fā)現(xiàn)的可能導致疾病的基因組變異。

數(shù)據(jù)共享

ClinVar數(shù)據(jù)庫匯總了有關基因組變異及其與人類健康的關系的信息，并促進了分享和比較來自不同研究和臨床組的基因變異分類的能力。這對ClinGen專家小組的工作至關重要，它允許他們與共享數(shù)據(jù)的實驗室密切合作，以解決基因變異解釋的差異，確保為患者提供更準確的結果。

ClinGen的患者登記處GenomeConnect使已接受基因組檢測的患者能夠將其基因組變異和臨床數(shù)據(jù)貢獻給ClinVar。截至2018年4月，來自32個國家的1,601名參與者參加了GenomeConnect。登記處還使患者能夠與臨床醫(yī)生，研究人員和其他參與者聯(lián)系。當執(zhí)行測試的實驗室更新有關其基因變異的信息時，也可以提醒注冊表參與者。到目前為止，已經(jīng)確定了13個更新，并且正在返回給選擇接收此信息的參與者。

一種通用語言

為了幫助建立基因組數(shù)據(jù)庫的共同語言以便彼此“交談”，ClinGen的設計者構建了ClinGen等位基因座，可以對基因變異進行通用鑒定。該登記處是全球基因組學和健康聯(lián)盟的一部分，該聯(lián)盟致力于制定標準，以支持負責任的數(shù)據(jù)共享，以促進基因組學和健康。

“ClinGen和ClinVar研究人員和臨床醫(yī)生不知疲倦地努力策劃用于基因組醫(yī)學和研究的知識，”Erin M. Ramos博士，公共衛(wèi)生碩士，以及NHGRI的ClinGen項目主任說。“這是一個巨大的挑戰(zhàn)，但社區(qū)正致力于自動化方法并加快我們的流程。鑒于臨床基因組檢測正變得越來越普遍，了解哪些基因變異導致疾病是必要的，以提供盡可能最好的護理。”

ClinGen和ClinVar的研究人員將在2018年10月16日至20日的美國人類遺傳學會年會上展示他們的工作。

ClinGen主要由NHGRI通過以下三項撥款資助：U41HG006834，U41HG009649和U41HG009650。ClinGen還通過以下三項撥款獲得NICHD的內(nèi)容管理支持：U24HD093483，U24HD093486和U24HD093487。在第一階段活動期間，NCI通過合同HHSN261200800001E支持ClinGen到2016年。ClinVar得到美國國立衛(wèi)生研究院內(nèi)部研究計劃，國家醫(yī)學圖書館的支持。

NHGRI是推進國立衛(wèi)生研究院基因組學研究的推動力。通過開展和資助世界一流的基因組學研究，培訓下一代基因組學專家，以及與不同社區(qū)合作，NHGRI加速了改善人類健康的科學和醫(yī)學突破。

關于Eunice Kennedy Shriver國家兒童健康與人類發(fā)展研究所(NICHD)：NICHD負責并支持美國和全世界關于胎兒，嬰兒和兒童發(fā)育的研究; 孕產(chǎn)婦，兒童和家庭健康; 生殖生物學和人口問題; 和醫(yī)療康復。