科學(xué)家繪制了危險(xiǎn)的瘧疾媒介蚊子的基因組圖譜
國(guó)際研究人員合作完成了中美洲和南美洲一種瘧疾病媒 - 瘧疾蚊子Anopheles albimanus的基因組物理圖譜研究。該地圖開(kāi)啟了研究瘧疾致病因素最危險(xiǎn)的載體之一的新篇章,每年有超過(guò)40萬(wàn)人死于此,并擴(kuò)大了與致命感染作斗爭(zhēng)的可能性。
“最有效的預(yù)防傳播瘧疾的方法是消滅疾病 - 瘧疾蚊子的攜帶者,”Ecogene實(shí)驗(yàn)室的高級(jí)研究員Gleb Artemov說(shuō)。“為了做到這一點(diǎn),我們使用不同的方法,從排水濕地到創(chuàng)造轉(zhuǎn)基因蚊子。開(kāi)發(fā)新方法需要研究按蚊屬的遺傳學(xué),生理學(xué)和生態(tài)學(xué),如果沒(méi)有關(guān)于其完整DNA序列的信息,這是不可能的。”
兩年來(lái),科學(xué)家研究了按蚊(Anopheles albimanus)的基因組。他們獲得了染色體圖像,并進(jìn)行了一系列廣泛的實(shí)驗(yàn)。2016年11月底,他們完成了蚊子基因組組裝的最全面版本,并展示了其實(shí)物圖。
“這是Anopheles屬基因組的第三個(gè)映射,”Ecogene的主要研究員兼弗吉尼亞??理工大學(xué)副教授Igor Sharahov說(shuō)。“最危險(xiǎn)的瘧疾蚊子按蚊岡比亞的第一張地圖于2002年出版,然后創(chuàng)建了亞洲物種按蚊(Anopheles stephensi)和生活在歐洲和俄羅斯的蚊子按蚊(Anopheles atroparvus)的地圖。比較這些物種揭示了新的基因組重排改變了不同染色體之間基因的順序。“
物理基因組圖譜允許通過(guò)比較不同物種中基因的順序來(lái)定義染色體上每個(gè)基因的位置并研究瘧疾蚊子的進(jìn)化。例如,該地圖可以幫助科學(xué)家創(chuàng)建轉(zhuǎn)基因蚊子,以確定將DNA片段整合到基因組中的最佳位置。
使用該地圖已經(jīng)幫助TSU和弗吉尼亞理工大學(xué)的科學(xué)家們檢測(cè)并糾正了Anopheles albimanus基因組裝配中的錯(cuò)誤。他們的研究成果是2017年1月在一份評(píng)價(jià)最高的科學(xué)期刊上發(fā)表的一篇文章的基礎(chǔ)。
新的基因組圖譜可在開(kāi)放式訪問(wèn)VectorBase中獲得。
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