科學(xué)家對入侵甘蔗蟾蜍的基因組進(jìn)行了測序
一個國際科學(xué)家小組對甘蔗蟾蜍(Rhinella marina)的基因組草圖進(jìn)行了測序和分析,這是一種原產(chǎn)于中美洲和南美洲的有毒兩棲動物,已遍布全球許多地區(qū)。該研究結(jié)果顯示在該雜志GigaScience。
甘蔗蟾蜍因其對入侵地區(qū)的本地動物群的快速適應(yīng)和有害影響而聞名。然而,盡管具有標(biāo)志性的地位,但對甘蔗蟾蜍遺傳學(xué)的理解存在重大差距。
基因組的可用性將有助于縮小這些差距并加速甘蔗蟾蜍的研究。
“盡管它具有標(biāo)志性的地位,但我們對甘蔗蟾蜍遺傳學(xué)的理解存在很大差距,到目前為止,還沒有人將基因組整合在一起,”研究資深作者,研究所的生物技術(shù)和生物分子科學(xué)學(xué)院的Peter White教授說。新南威爾士大學(xué)。
“測序和組裝基因組是一個復(fù)雜的過程,”第一作者Rich Edwards博士說,他也來自新南威爾士大學(xué)生物技術(shù)與生物分子科學(xué)學(xué)院。
“通過使用最先進(jìn)的測序技術(shù)和專業(yè)知識,我們對360億個堿基對進(jìn)行了測序,并組裝了迄今為止最優(yōu)質(zhì)的兩棲動物基因組之一。”
“我們設(shè)法使用能夠測序非常長的DNA片段的技術(shù)破譯了超過90%的甘蔗蟾蜍基因,這使得將基因組拼圖更容易組裝起來。”
現(xiàn)在可以以更低的成本對更多的蟾蜍進(jìn)行測序,并且基因組是免費(fèi)提供的 - 任何人都可以現(xiàn)在訪問它并進(jìn)行進(jìn)一步的研究。
“對基因組的未來分析將提供對甘蔗蟾蜍進(jìn)化的見解,并豐富我們對它們與生態(tài)系統(tǒng)相互作用的理解 - 它將幫助我們了解蟾蜍如何傳播,毒素如何起作用,并提供新的途徑來試圖控制它人口,“ 來自悉尼大學(xué)的共同作者Rick Shine教授說。
“到目前為止,很少有兩棲類基因組進(jìn)行測序,因此這對兩棲動物來說也是一個好消息。擁有參考基因組可以為入侵物種如何進(jìn)化以適應(yīng)新環(huán)境提供有價值的見解。“
擁有基因組也將幫助研究人員找到控制蟾蜍種群的新選擇。
“當(dāng)前的物理清除措施并沒有取得成功,但教導(dǎo)本地物種不吃蟾蜍的新方法 - 稱為味覺厭惡 - 給了新的希望,”懷特教授說。
“但是,我們需要更多的方法來控制這種入侵物種。”
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