發(fā)現(xiàn)準(zhǔn)確轉(zhuǎn)錄DNA會(huì)覆蓋DNA修復(fù)
一個(gè)突破性和令人驚訝的發(fā)現(xiàn)為細(xì)胞最重要的事物提供了一個(gè)重大的概念變化:DNA轉(zhuǎn)錄過(guò)程的保真度 - 準(zhǔn)確地將DNA信息復(fù)制到RNA中,蛋白質(zhì)的前體 - 或DNA修復(fù),從而避免丟失的染色體丟失。據(jù)“自然”雜志報(bào)道,研究人員發(fā)現(xiàn),在模式生物大腸桿菌中,轉(zhuǎn)錄DNA的保真度是以DNA修復(fù)為代價(jià)的。
“如果你問(wèn)一群對(duì)細(xì)胞更重要的科學(xué)家,保持其DNA的完整性,包含所有有機(jī)體的遺傳信息,或轉(zhuǎn)錄的保真度 - 將DNA轉(zhuǎn)錄成RNA,從而導(dǎo)致蛋白質(zhì)合成的過(guò)程 - 絕大多數(shù)人都同意修復(fù)DNA更為重要,“貝勒醫(yī)學(xué)院分子與人類(lèi)遺傳學(xué)和分子病毒學(xué)與微生物學(xué)副教授Christophe Herman博士說(shuō)。“在這項(xiàng)研究中,我們表現(xiàn)出相反的結(jié)果。”
眾所周知,DNA斷裂對(duì)于細(xì)胞來(lái)說(shuō)是麻煩的,因?yàn)槿绻荒苷_修復(fù),它們會(huì)導(dǎo)致細(xì)胞基因或細(xì)胞死亡的主要不穩(wěn)定性。相反,轉(zhuǎn)錄過(guò)程中的錯(cuò)誤通常被認(rèn)為不太重要,因?yàn)檗D(zhuǎn)錄本是臨時(shí)的,如果一個(gè)是有缺陷的,細(xì)胞可以制造另一個(gè)。由于這些原因,大多數(shù)研究人員認(rèn)為DNA斷裂修復(fù)將超過(guò)轉(zhuǎn)錄以保護(hù)DNA完整性,并防止細(xì)胞丟失其染色體。
“幾十年來(lái),科學(xué)家一直在研究DNA修復(fù),并產(chǎn)生了大量有關(guān)它的信息。相比之下,我們對(duì)轉(zhuǎn)錄保真度知之甚少,”Herman說(shuō),他也是Dan L Duncan綜合癌癥中心的成員。“我的實(shí)驗(yàn)室在過(guò)去的12年里一直在研究轉(zhuǎn)錄的保真度。我們多年前就已經(jīng)證明轉(zhuǎn)錄錯(cuò)誤會(huì)導(dǎo)致遺傳變化。這讓我們認(rèn)為轉(zhuǎn)錄保真度可能比我們?cè)认胂蟮母匾T谶@項(xiàng)研究中,我們想要調(diào)查去除GreA的后果,這是一個(gè)有助于確保轉(zhuǎn)錄過(guò)程對(duì)細(xì)菌大腸桿菌的保真度的因素,對(duì)DNA斷裂修復(fù)。“
意外的發(fā)現(xiàn)
“在去除GreA后,細(xì)菌在修復(fù)模擬輻射的藥物造成的DNA損傷方面的效率提高了數(shù)百倍,”第一作者Priya Sivaramakrishnan博士說(shuō)。在該項(xiàng)目的開(kāi)發(fā)期間,Herman實(shí)驗(yàn)室的學(xué)生。“當(dāng)GreA不存在時(shí),細(xì)菌可以更快地修復(fù)DNA斷裂。”
為了確定缺失轉(zhuǎn)錄保真度如何導(dǎo)致更快的修復(fù),研究人員開(kāi)發(fā)了一種新的全基因組測(cè)序方法,他們將其命名為eXOnucleases測(cè)序(XO-seq),以物理可視化活細(xì)胞中DNA修復(fù)的不同步驟。利用這種方法和其他方法,研究人員確定了GreA缺失促進(jìn)DNA修復(fù)的分子機(jī)制。
轉(zhuǎn)錄保真因子GreA阻止DNA修復(fù)的發(fā)現(xiàn)代表了DNA世界的一個(gè)主要范式轉(zhuǎn)變,因?yàn)樗馕吨_保正確的轉(zhuǎn)錄保真度是以降低細(xì)胞修復(fù)DNA的能力為代價(jià)的。“這完全出乎意料,”赫爾曼說(shuō)。
“有一個(gè)過(guò)程可以幫助將DNA轉(zhuǎn)化為高質(zhì)量的RNA,從而產(chǎn)生高質(zhì)量的蛋白質(zhì),細(xì)菌在DNA修復(fù)效率上付出了百倍的代價(jià),”共同作者Susan Rosenberg博士說(shuō),Ben F. Love Chair在癌癥研究和分子和人類(lèi)遺傳學(xué)教授,分子病毒學(xué)和微生物學(xué)以及貝勒的生物化學(xué)和分子生物學(xué)。羅森伯格還是貝勒Dan L Duncan綜合癌癥中心癌癥進(jìn)化計(jì)劃的領(lǐng)導(dǎo)者。
“從細(xì)菌到人類(lèi)的核酸基本生物學(xué)的保護(hù)是巨大的,”羅森伯格說(shuō)。“我們假設(shè)在大腸桿菌中發(fā)現(xiàn)的這種機(jī)制也可能存在于其他細(xì)胞中,這將在許多領(lǐng)域產(chǎn)生影響,從癌癥到進(jìn)化。”
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