人類腸道微生物組參考基因的綜合目錄
一個小組為大多數(shù)腸道微生物建立了一個不到1000萬個基因的綜合基因目錄,提供了最全面的免費數(shù)據(jù)庫,涵蓋了世界各地人類腸道微生物組的多樣性。
人體腸道微生物群是腸道中的微生物群。新目錄包括大多數(shù)這些腸道微生物的接近完整的基因組。它應(yīng)該幫助科學(xué)家了解他們在不同人群中的變異,以及他們?nèi)绾谓沂窘】岛图膊?biāo)記。
研究人員 - 包括醫(yī)學(xué)院的Jumana Yousuf Al-Aama,王軍和沙特阿拉伯國王阿卜杜勒阿齊茲大學(xué)(KAU)科學(xué)系的Sherif Edris - 將以前分散的數(shù)據(jù)與不同的研究結(jié)合起來。該研究表明,樣本創(chuàng)建了來自三大洲的隊列,至少比以前的基因目錄大三倍。
研究人員還展示了如何使用目錄發(fā)現(xiàn)腸道微生物群的特定群體特征。
他們使用他們的目錄分析了來自60個中國南方和100個丹麥健康個體的表型匹配組的一組樣本,它確實揭示了特定國家的腸道微生物特征,特別是涉及飲食相關(guān)過程,如碳水化合物和氨基酸代謝。
該目錄還幫助科學(xué)家比較和繪制個體特異性基因(發(fā)現(xiàn)在不到1%的個體中)和常見基因(發(fā)現(xiàn)超過50%)之間的功能差異。
Wang表示,與常見基因相比,個體特異性基因的豐富功能反映了腸道微生物在應(yīng)對宿主免疫系統(tǒng),病毒感染和抗生素治療等各種挑戰(zhàn)中的適應(yīng)能力。
“對腸道宏基因組的理解還處于早期階段,”王說。“但這是我們第一次在1000個樣本水平上研究腸道微生物群中的常見和稀有實體。”
該研究發(fā)表在Nature Biotechnology1上,數(shù)據(jù)庫可在此處獲取。
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