DNA片段揭示了河流中的物種種類
河流中的遺傳物質(zhì)比特使得探測生物體中的生物成為可能 - 無需收集這些物質(zhì)并在顯微鏡下檢查它們。Eawag,ETH和EPFL的研究人員現(xiàn)已開發(fā)出一種計算機(jī)模型,在單一DNA測量的幫助下,甚至可以模擬物種在水體中存在的確切位置和頻率。
每個生物都留下遺傳物質(zhì)的微小痕跡,例如死皮細(xì)胞或排泄物。如果一個人現(xiàn)在取水樣并解碼其中的環(huán)境DNA(也稱為eDNA),就會知道哪個物種在哪個水域中徘徊。因此,人們發(fā)現(xiàn)在正常測試期間從字面上掉落的稀有物種。可以肯定的是,eDNA的這個概念早已為人所知。但是:“到目前為止,人們可以從eDNA中確定一個物種是否存在。但是這個物種如何在整個生態(tài)系統(tǒng)中分布是未知的,”Luca Carraro說。在今年夏天在EPFL完成環(huán)境水文學(xué)博士學(xué)位后,他現(xiàn)在是Eawag研究員。
他與Eawag,ETH和EPFL的研究人員一起成功地通過選擇性eDNA測量重建了物種的廣泛存在。Carraro和他的同事們首次使用該方法確定了Wigger(一種瑞士阿爾卑斯山河)中的苔蘚蟲(Fredericella sultana)及其寄生蟲(Tetracapsuloides bryosalmonae)的生物量分布。寄生蟲導(dǎo)致可怕的魚病PKD,每年在瑞士帶走數(shù)千條鱒魚。
計算機(jī)模型考慮了水文學(xué)和生態(tài)學(xué)
為了盡可能準(zhǔn)確地確定生物的分布,研究人員開發(fā)了一個基于河網(wǎng)中水文和生態(tài)概念的計算機(jī)模型。將遺傳物質(zhì)測量結(jié)果輸入模型,并考慮沿河的eDNA片段的運(yùn)輸和分解,以及當(dāng)?shù)氐沫h(huán)境因素。“這種方法可以簡單而廉價地監(jiān)測世界各地的生物多樣性。迄今為止,傳統(tǒng)方法無法做到這一點(diǎn),”共同作者和Eawag研究組組長Hanna Hartikainen說。
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