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      揭示神秘小蛋白的作用
      
			
      
				2019-02-23 10:03:12
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      人類基因組包含估計(jì)20,000個(gè)編碼蛋白質(zhì)的基因。蛋白質(zhì)是身體的“工作者”，其任務(wù)是執(zhí)行對(duì)生存至關(guān)重要的特定功能。盡管它們很重要，但是有一種非常小的蛋白質(zhì)，少于100個(gè)氨基酸，對(duì)于理解生物是如何工作以及哪些研究人員知之甚少至關(guān)重要，因?yàn)閮H僅識(shí)別它們是一個(gè)真正的技術(shù)挑戰(zhàn)。
      

      揭示神秘小蛋白的作用
      

      然而，現(xiàn)在，由生物系統(tǒng)設(shè)計(jì)組負(fù)責(zé)人ICREA研究教授Luis Serrano領(lǐng)導(dǎo)的巴塞羅那基因組調(diào)控中心(CRG)的研究人員已開發(fā)出一種技術(shù)，可以根據(jù)新的技術(shù)對(duì)這些蛋白質(zhì)進(jìn)行預(yù)測和分類。生物信息學(xué)工具，他們提供多元數(shù)據(jù)。這使他們發(fā)現(xiàn)這些小蛋白質(zhì)占細(xì)菌基因組的至少16%。他們的研究成果發(fā)表在Molecular Systems Biology期刊上。
      

      “我們對(duì)肺炎支原體細(xì)菌進(jìn)行了研究，結(jié)果發(fā)現(xiàn)，我們可以忽略其減少的基因組中編碼的每100種蛋白質(zhì)中的10種，因?yàn)樗鼈兎浅Ｐ。?rdquo;CRG的工作人員科學(xué)家MaríaLluch-Senar說道。研究的主要研究者。“在更復(fù)雜或人類生物的情況下，這個(gè)百分比可能非常重要，”她補(bǔ)充道。
      

      最近的研究揭示了這些小蛋白質(zhì)的重要??性，例如昆蟲，動(dòng)物，植物甚至人類分泌的抗菌肽對(duì)感染的反應(yīng)。這些小蛋白質(zhì)也被證明可以與環(huán)境中的其他細(xì)菌以及宿主(如我們的生物體)進(jìn)行交流。事實(shí)上，它們可能在平衡微生物群中發(fā)揮著非常重要的作用。
      

      “我們研究的興趣在于確定這些迄今為止被忽視的蛋白質(zhì)可以呈現(xiàn)的功能的數(shù)量和種類，”Samuel Miravet-Verde博士解釋說。CRG的學(xué)生和工作的主要作者。
      

      以前，當(dāng)基因組被注釋時(shí)，研究人員只能解釋在轉(zhuǎn)錄和翻譯后可以產(chǎn)生超過100 個(gè)氨基酸的蛋白質(zhì)的DNA片段。由于涉及技術(shù)挑戰(zhàn)，低于此數(shù)量的任何東西都被忽視，因?yàn)橛糜阼b定蛋白質(zhì)的常用方法是不可能的，因?yàn)樗鼈兎浅Ｐ?。由于這些蛋白質(zhì)具有非常短的壽命，它們不豐富，或者它們呈現(xiàn)組織和時(shí)間特異性表達(dá)模式使得它們更難以檢測，因此這進(jìn)一步復(fù)雜化。
      

      此外，通常進(jìn)行比較保守性研究，以便能夠?yàn)榈鞍踪|(zhì)分配功能，其中采集不同的生物體并嘗試確定它們的存在程度，比較它們的長度并確定它們之間的相似性。它們是或不重要。由于無法識(shí)別這些小蛋白質(zhì)，因此不能采用這種方法對(duì)生物進(jìn)行比較，因此它們的作用仍然是個(gè)謎。
      

      在這項(xiàng)研究中，研究人員對(duì)109種細(xì)菌基因組進(jìn)行了初步研究，他們試圖對(duì)這些蛋白質(zhì)進(jìn)行分類或分配。為此，他們應(yīng)用已經(jīng)在其他設(shè)置中使用的算法，他們輸入與蛋白質(zhì)性質(zhì)相關(guān)的參數(shù)。他們隨后通過使用已在其他細(xì)菌物種中鑒定的蛋白質(zhì)驗(yàn)證了他們的發(fā)現(xiàn)。
      

      他們開發(fā)的技術(shù)是通用的，可以應(yīng)用于不同的細(xì)菌物種。
      
			

			
        
      
			
      
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