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      算法估計(jì)癌性表觀遺傳變化
      
			
      
				2018-12-08 13:24:42
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      在細(xì)胞核內(nèi)部，DNA被包裹在染色體結(jié)構(gòu)內(nèi)稱為組蛋白的蛋白質(zhì)周圍。酶可以異常修飾這些組蛋白，沉默產(chǎn)生抑制癌癥的蛋白質(zhì)的某些基因?，F(xiàn)在，一個(gè)國際研究團(tuán)隊(duì)已經(jīng)設(shè)計(jì)出一種基于計(jì)算機(jī)的模型，可以檢測癌細(xì)胞染色體中的組蛋白修飾，并將其結(jié)果發(fā)表在Bioinformatics1中。
      

      該模型被稱為癌癥中的組蛋白修飾(HMCan)，是一種分析和鑒定組蛋白修飾的算法。它使用來自ChIP測序(ChIP-Seq)的數(shù)據(jù)來估計(jì)癌細(xì)胞基因組中基因的拷貝數(shù)改變，ChIP測序是一種分析蛋白質(zhì)和DNA之間相互作用的方法。
      

      算法估計(jì)癌性表觀遺傳變化
      

      為了測試HMCan的功效，來自沙特阿拉伯Thuwal的阿卜杜拉國王科技大學(xué)(KAUST)和巴黎居里研究所以及巴黎科技礦業(yè)的研究人員將其與其他三種已用于分析正常數(shù)據(jù)的工具進(jìn)行了比較?；蚪M。HMCan能夠比所有三種工具更好地檢測模擬癌癥基因組中組蛋白修飾的跡象。
      

      他們隨后在培養(yǎng)的人類膀胱癌細(xì)胞上測試了HMCan，其中“提供了比識別組蛋白修飾的三種工具更好的結(jié)果，”研究的共同作者Valentina Boeva說。
      

      這可以允許醫(yī)生檢測組蛋白修飾，這可以用于設(shè)計(jì)抗癌藥物以消除這些癌變化。
      
			

			
        
      
			
      
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