卡塔爾的外顯子序列 以預(yù)測(cè)對(duì)兩種常見(jiàn)血液稀釋劑的反應(yīng)
科學(xué)家們利用100 Qataris全外顯子組測(cè)序的信息,創(chuàng)建了與兩種抗凝血?jiǎng)┫嚓P(guān)的藥物遺傳變異的綜合圖譜。
這項(xiàng)來(lái)自德里CSIR基因組學(xué)和綜合生物學(xué)研究所的研究小組將首次嘗試預(yù)測(cè)卡塔爾病人對(duì)基于其基因構(gòu)成的藥物的反應(yīng)。該研究將出現(xiàn)在藥物基因組學(xué)中。
這項(xiàng)工作屬于藥物遺傳學(xué)領(lǐng)域,這是一個(gè)相對(duì)較新的研究領(lǐng)域,它源于基因組學(xué)的進(jìn)步,研究遺傳了代謝途徑中的遺傳差異,可以影響個(gè)體對(duì)藥物的反應(yīng)。
在這項(xiàng)研究中,科學(xué)家們研究了華法林和氯吡格雷,這是阿拉伯患者中兩種最廣泛使用的口服抗凝劑。
鑒于這個(gè)海灣國(guó)家存在的遺傳多樣性,其人口可以追溯到非洲,波斯南亞或貝都因人的血統(tǒng),這些藥物的給藥劑量水平應(yīng)該有很大差異,以提高療效和減少副作用。
Vinod Scaria是一位專(zhuān)門(mén)研究精密醫(yī)學(xué)的印度研究人員,他的研究團(tuán)隊(duì)基于最初由威爾康奈爾醫(yī)學(xué)院的卡塔爾和紐約研究人員收集的外顯子組織數(shù)據(jù)1。他們的研究領(lǐng)域結(jié)合了諸如個(gè)人的基因構(gòu)成,環(huán)境,年齡,生活方式和飲食以及其他藥物等因素,以實(shí)現(xiàn)疾病的精確診斷,治療和管理。
“這些年來(lái),阿拉伯人口缺乏基因數(shù)據(jù)是一個(gè)主要障礙。”
由于大多數(shù)藥物的藥物臨床試驗(yàn)和劑量算法主要來(lái)自歐洲高加索人群,因此尚未對(duì)阿拉伯人群充分研究藥物無(wú)效或造成傷害的可能性。
在卡塔爾,心血管疾病是導(dǎo)致死亡的首要原因,2012年,世界衛(wèi)生組織將約400人死于缺血性心臟病 - 華法林和氯吡格雷可以緩解或預(yù)防這種疾病。這些藥物可以防止凝塊形成或幫助它們?cè)谘苤蟹纸狻K鼈兺ǔS糜谛呐K或腦血流中斷的患者或經(jīng)過(guò)血管成形術(shù)的患者。
由于這些藥物會(huì)增加血栓形成所需的時(shí)間,因此可能會(huì)出現(xiàn)出血或出血過(guò)多。
“華法林是世界各地廣泛使用的血液稀釋劑,如果你服用不足,那么你的血栓風(fēng)險(xiǎn)就會(huì)增加,如果過(guò)多則會(huì)增加出血風(fēng)險(xiǎn),這可能危及生命,致命的,“威爾康奈爾醫(yī)學(xué)院遺傳醫(yī)學(xué)主席羅納德·克里斯特說(shuō),他提供了Scaria和他的團(tuán)隊(duì)獨(dú)立使用的原始數(shù)據(jù)集。“因此,正確的劑量是非常重要的。”
Scaria說(shuō),多年來(lái),阿拉伯人群缺乏基因數(shù)據(jù)。“來(lái)自卡塔爾外顯子組的數(shù)據(jù)提供了能夠分析遺傳變異及其頻率以創(chuàng)建藥物遺傳學(xué)圖譜的能力,”他解釋說(shuō)。
整個(gè)外顯子組序列的可用性允許CSIR在群體水平上一起研究許多變體。“像Scaria博士這樣的研究正是我們研究卡塔爾基因組的原因,”Crystal評(píng)論道。
根據(jù)共同研究員Ambily Sivadas的說(shuō)法,細(xì)胞色素(CYP)基因是決定藥物代謝的基因。
“一小部分卡塔爾人有兩個(gè)CYP2C9 * 2變異的非功能性拷貝(純合子),這顯著降低了華法林的代謝,并且需要較低劑量的藥物,而絕大多數(shù)人有CYP4F2的變體,需要更高的劑量,“他解釋說(shuō)。
大約70%的人患有CYP2C9 * 2變異體,而一半患有CYP4F2變體的人患有貝都因人血統(tǒng)。考慮到所研究人群的樣本量很少,研究貝都因人卡塔爾人,非洲人和波斯人 - 南亞人后裔的科學(xué)家們對(duì)這三個(gè)不同亞人群之間的顯著差異感到驚訝。
他們還發(fā)現(xiàn)人群中與變異CYP2C19 * 3相關(guān)的氯吡格雷抗性非常低,這表明氯吡格雷在卡塔爾中非常有效。
“基因檢測(cè)將提供通過(guò)調(diào)節(jié)劑量來(lái)避免不良事件的機(jī)會(huì),或者在某些情況下,將其與相容的替代藥物交換。因此,它可以在個(gè)體水平上實(shí)現(xiàn)精確度,并為治療方案帶來(lái)更好的結(jié)果,“Scaria說(shuō)。
本文的早期版本指出,Vinod Scaria隸屬于卡塔爾的威爾康奈爾醫(yī)學(xué)院,這是不正確的。他和他的團(tuán)隊(duì)使用了威爾康奈爾醫(yī)學(xué)院研究人員制作的數(shù)據(jù)集。
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