不同的真菌分泌相似的分解酶組
土壤真菌分泌多種酶,這些酶在生物燃料生產(chǎn)和金屬污染土壤和水的生物修復中發(fā)揮重要作用。最近的一項研究表明,盡管這些酶的氨基酸序列存在物種特異性差異,但不同的真菌物種分泌了豐富的具有相似功能的酶。該研究增強了對真菌在土壤中發(fā)生的過程中所起作用的理解。該研究可用于設(shè)計真菌酶用于生物燃料生產(chǎn)和生物修復工作。
真菌分泌多種多樣的酶,可以分解頑強的植物材料。這些強效酶降解植物細胞壁成分例如纖維素和木質(zhì)素,導致二氧化碳從含有死植物材料的土壤釋放到大氣中。因此,真菌酶不僅是氣候動力學的關(guān)鍵驅(qū)動因素,而且還有望從生物質(zhì)中經(jīng)濟有效地開發(fā)替代運輸燃料。此外,可以利用某些真菌物種的錳[Mn(II)] - 氧化能力來去除污染的土壤和水中的有毒金屬。然而,很少有研究表征由在環(huán)境中常見的各種Mn(II)氧化真菌分泌的酶。最近,一組研究人員使用液相色譜 - 串聯(lián)質(zhì)譜(LC-MS / MS),基因組分析和生物信息學分析來表征和比較四種Mn(II)氧化子囊菌屬物種分泌的酶。
研究人員在環(huán)境分子科學實驗室(EMSL),能源部(DOE)科學辦公室用戶設(shè)施中使用線性離子阱四極桿Orbitrap Velos質(zhì)譜儀進行了基于LC-MS / MS的比較蛋白質(zhì)組學研究。該分析揭示了真菌分泌豐富但功能相似的酶組,盡管這些酶的氨基酸序列存在物種特異性差異。這些發(fā)現(xiàn)增強了對子囊菌屬物種在生物地球化學和氣候動力學中的作用的理解,并揭示了可用于可再生能源生產(chǎn)或金屬污染水的生物修復的木質(zhì)纖維素降解酶。
這項研究代表了哈佛大學,EMSL,太平洋西北國家實驗室,史密森學會,美國能源部聯(lián)合基因組研究所(JGI),國家科學研究中心和明尼蘇達大學阿卜杜勒阿齊茲國王大學Aix-MarseilleUniversit的科學家之間的合作,以及伍茲霍爾海洋研究所。
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