結合補充資源提高科學認識
美國能源部聯(lián)合基因組研究所(DOE JGI)和環(huán)境分子科學實驗室(EMSL)已接受了2014年合作科學倡議提案期間提交的12個項目。
協(xié)作呼叫為研究人員提供了一個獨特的機會,將基因組學和分子鑒定的力量結合在一個研究項目中,以幫助推進能源部生物和環(huán)境研究辦公室(BER)的使命。選定的研究人員將能夠訪問兩個用戶設施的功能。他們還將能夠生成這兩個設施獨有的數據集 - 超出任何一個設施本身可以生成的數據集。
“這些批準的項目代表了生物地球化學,碳循環(huán)和生物燃料/生物產品生產研究的優(yōu)秀橫截面,”EMSL生物系統(tǒng)動力學和設計科學主題負責人Scott Baker說。“繼續(xù)與JGI合作非常令人興奮,我期待這些項目產生的見解和影響。”
接受的提案將于2014年10月1日開始,包括:
將微生物群落與地下水 - 地表水相互作用區(qū)中的碳和污染物生物地球化學相結合。PI-James Stegen,西北太平洋國家實驗室
解碼DOM降解:碳源和陽光暴露如何改變微生物代謝和基因組編碼的永久凍土有機物代謝退化的表達?PI-Byron Crump,俄勒岡州立大學
解剖真菌木材腐爛的種內多樣性。 PI-Ronald de Vries,CBS-KNAW真菌生物多樣性中心
闡明工程化N-糖基化基序對細菌生物質水解酶的影響,以及對黑曲霉中異源和天然基因表達,分泌和降解的影響。 西北太平洋國家實驗室PI-Jon Magnuson
微生物聚生體的綜合生物地球化學模擬,介導動態(tài)甲烷水合物沉積物中甲烷的厭氧氧化。 PI-Frederick Colwell,俄勒岡州立大學
整合基因組/轉錄組學/分泌組學研究松樹蘑菇屬中松樹與其共生的外生菌根真菌之間的植物 - 真菌相互作用。 杜克大學PI-Rytas Vilgalys
繪制植物 - 微生物共生中營養(yǎng)和碳交換的代謝。 西弗吉尼亞大學PI-Jonathan Cumming
深層地下頁巖碳儲層生物地球化學循環(huán)的微生物控制。 PI-Kelly Wrighton,俄亥俄州立大學
量化差異表達并識別產甲烷途徑中的瓶頸。PI-Zaida Luthey-Schulten,伊利諾伊大學厄巴納 - 香檳分校
通過外膜β-桶蛋白感應外部金屬。 喬治亞理工學院PI-Thomas DiChristina
通過平行的高分辨率有機物質和微生物群落特征,解凍永久凍土融化過程中碳轉化的系統(tǒng)級見解。PI-Virginia Rich,亞利桑那大學
揭示浮萍的水生微生物組的組成和功能。 田納西大學PI-Sarah Lebeis
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