NHGRI研究人員回顧了透明細(xì)胞子宮內(nèi)膜癌的突變譜
在迄今為止最大的透明細(xì)胞子宮內(nèi)膜癌(CCEC)腫瘤基因組學(xué)研究中,國(guó)家人類基因組研究所(NHGRI)的研究人員和他們的合作者已經(jīng)確定了TAF1 基因的突變。他們還證明了CCEC腫瘤的突變譜有時(shí)與其他類型的子宮癌類似,即漿液性子宮內(nèi)膜癌或子宮內(nèi)膜樣子宮內(nèi)膜癌。該研究于2017年5月9日發(fā)表在“ 癌癥 ”雜志上。
子宮內(nèi)膜癌是最常診斷的婦科癌癥,全世界每年有超過8,000名美國(guó)女性和76,000名女性死于此病。幸運(yùn)的是,最常見的子宮內(nèi)膜癌類型,子宮內(nèi)膜樣子宮內(nèi)膜癌,往往早期診斷,一般對(duì)治療反應(yīng)良好; 一項(xiàng)研究報(bào)告,五年相對(duì)存活率為91%。然而,患有CCEC或漿液性子宮內(nèi)膜癌的女性,兩種罕見的子宮內(nèi)膜癌,一般都有較差的臨床結(jié)果:一項(xiàng)研究報(bào)道,CCEC女性的五年相對(duì)存活率為65%,患有漿液性子宮內(nèi)膜癌的女性患有五年相對(duì)存活率為45%。
“導(dǎo)致透明細(xì)胞子宮內(nèi)膜癌的基因組突變可能因患者而異,”NHGRI 癌癥遺傳學(xué)和比較基因組學(xué)分部的資深作者和高級(jí)研究員Daphne W. Bell博士說。“因?yàn)榘┌Y經(jīng)常在子宮外擴(kuò)散后被診斷出來,所以死亡率高得令人無法接受。我們正試圖建立一個(gè)知識(shí)基礎(chǔ),以破譯驅(qū)動(dòng)這些癌癥的基因組變化。” 貝爾博士和她的團(tuán)隊(duì)專注于基礎(chǔ)研究,旨在識(shí)別臨床侵襲性子宮內(nèi)膜癌患者腫瘤中突變(改變)的基因。
貝爾博士和她的團(tuán)隊(duì)從腫瘤細(xì)胞和CCEC患者的正常細(xì)胞中分離出DNA。他們的目標(biāo)是確定正常細(xì)胞中不存在的CCEC腫瘤細(xì)胞的基因突變。研究小組測(cè)定了外顯子組,腫瘤蛋白編碼區(qū)的構(gòu)建模塊(核苷酸)和16名CCEC患者的正常DNA,并發(fā)現(xiàn)了腫瘤中222個(gè)基因的突變。該研究小組將這222個(gè)基因列表縮小為22個(gè)“感興趣的基因”,代表在一個(gè)以上CCEC患者中突變的基因,先前與CCEC有關(guān)的基因,和/或在透明細(xì)胞卵巢癌中突變的基因。該團(tuán)隊(duì)進(jìn)一步搜索了來自另外47名CCEC患者的腫瘤DNA中這22個(gè)感興趣基因的突變。他們的結(jié)果定義了先前與CCEC有關(guān)的基因的突變頻率(TP53,PPP2R1A,PIK3R1,SPOP,PIK3CA,ARID1A和FBXW7)跨越最大的CCEC患者組。
他們還揭示了TAF1基因的突變,這是一種先前未涉及CCEC的基因。TAF1編碼轉(zhuǎn)錄因子復(fù)合物的一部分,其調(diào)節(jié)整個(gè)基因組中其他基因的表達(dá)。此外,研究人員研究了CCEC患者腫瘤中基因突變的模式,發(fā)現(xiàn)大量CCEC類似于漿液性子宮內(nèi)膜癌或子宮內(nèi)膜樣子宮內(nèi)膜癌。
該研究結(jié)果揭示了潛在的基因組變化,這些變化可能對(duì)推動(dòng)CCEC的發(fā)展具有重要意義,CCEC是一種罕見但臨床上具有侵襲性的子宮內(nèi)膜癌。
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