在四篇相關(guān)論文中研究人員描述了新的和改進(jìn)的干細(xì)胞研究工具
誘導(dǎo)多能干細(xì)胞(iPSCs)衍生自人類成體細(xì)胞并且能夠分化成各種細(xì)胞類型,是研究從人類疾病的分子過程到與人類表型相關(guān)的難以捉摸的遺傳變異的一切的有力工具。
4月6日在線發(fā)表在干細(xì)胞報(bào)告上的一篇新論文中,由加州大學(xué)圣地亞哥分校醫(yī)學(xué)院兒科學(xué)教授和基因組醫(yī)學(xué)研究所所長Kelly Frazer博士領(lǐng)導(dǎo)的一個(gè)由研究人員組成的大型研究小組描述了一個(gè)新的論文。收集222個(gè)系統(tǒng)衍生和表征的iPSC系列,作為國家心臟,肺和血液研究所的NextGen財(cái)團(tuán)的一部分。
Frazer稱iPSCORE為“用于Omic研究的iPSC集合”,稱該新穎集合解決了目前阻礙使用iPSC作為人類遺傳學(xué)研究模型系統(tǒng)的一些重要問題,這些研究調(diào)查了性狀的分離,例如缺乏大量分子良好表型種族多樣性的界線和代表,以及來自家庭和遺傳無關(guān)個(gè)體的參與者。
“iPSCORE系列包含75條來自非歐洲血統(tǒng)的人,包括東亞,南亞,非裔美國人,墨西哥裔美國人和多種族。它包括多代家庭和單卵雙胞胎,”弗雷澤說。“這個(gè)系列將使我們能夠研究遺傳變異如何在分子和生理水平上影響適當(dāng)?shù)娜祟惣?xì)胞類型(如心肌細(xì)胞)中的特征。它將有助于研究人員不僅調(diào)查常見而且罕見,甚至家庭 -具體的變化。“
在干細(xì)胞報(bào)告紙,其實(shí),四個(gè)相關(guān)的研究只是一個(gè)由不同的團(tuán)隊(duì)的科學(xué)家,每個(gè)弗雷澤作為資深作者出版。其他三項(xiàng)研究都利用iPSCORE資源來解決重要的遺傳問題或開發(fā)用于分析iPSC系列的新工具:
Frazer及其同事在4月6日發(fā)表的Cell Stem Cell在線期刊中使用了來自不同供體的215個(gè)人iPSC系的全基因組測序和基因表達(dá)譜,以鑒定與5,746個(gè)基因的RNA表達(dá)相關(guān)的遺傳變異。這項(xiàng)工作突出了iPSCs用于遺傳關(guān)聯(lián)分析和研究多能干細(xì)胞中基因表達(dá)的遺傳調(diào)控的價(jià)值。
同樣在細(xì)胞干細(xì)胞的同一期中,F(xiàn)razer及其同事提供了對iPSC中存在的異常甲基化模式的重要見解,這些模式將能夠更好地利用這些細(xì)胞來研究發(fā)育和疾病。
最后,在4月6日的Stem Cell Reports期刊中,F(xiàn)razer及其同事開發(fā)了一套簡單的方法來降低成本并增加iPSC生產(chǎn)線的有用產(chǎn)量。具體而言,它們概述了用于表面標(biāo)志物的高通量定量,體外分化潛能的基因表達(dá)分析和用于檢測染色體畸變的高分辨率核型分析的較便宜的方法。
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