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CRISPR揭示哪種基因融合對癌細胞的生長至關重要

2019-05-17 09:06:00 ? 來源：

在第一次大規(guī)模分析癌癥基因融合，這是由兩個先前分離的基因合并而來的，Wellcome Sanger研究所的研究人員，EMBL-EBI，Open Targets，GSK及其合作者使用CRISPR來揭示哪些基因融合是對癌細胞的生長至關重要。該團隊還發(fā)現(xiàn)了一種新的基因融合體，它可以為多種癌癥提供新的藥物靶點，包括腦癌和卵巢癌。

今天(5月16日)在Nature Communications上發(fā)表的研究結果為使用特定基因融合物診斷和指導患者治療提供了更多的確定性。研究人員表示，基于腫瘤中發(fā)現(xiàn)的基因融合，現(xiàn)有藥物可以用于治療一些患有胰腺癌，乳腺癌和肺癌的人。

由兩種不同基因的異常連接引起的基因融合在癌癥的發(fā)展中起重要作用。它們目前被用作診斷工具，用于預測特定癌癥患者對藥物的反應以及預后，以評估給予最佳護理的患者的結果。它們也是一些針對癌癥的最新靶向治療的目標。

到目前為止，研究人員已經確定了大約20,000個基因融合體，但是它們在發(fā)展癌癥中的確切功能和作用仍然知之甚少。辨別在癌癥存活中發(fā)揮作用的融合與不具有重要臨床意義的融合之間存在差異。

在第一項基因融合功能的大規(guī)模研究中，Wellcome Sanger研究所，EMBL-EBI，Open Targets，GSK及其合作者的研究人員分析了來自43種不同癌癥類型的1,000多種人類癌細胞系中的8000多種基因融合，包括臨床需求未得到滿足的兒科癌癥和癌癥。

該團隊針對超過350種抗癌藥物測試了這些細胞系，以了解哪些現(xiàn)有藥物可以重新用于治療具有基因融合的癌癥患者，并使用CRISPR作為工具來發(fā)現(xiàn)哪些關鍵基因融合對癌細胞存活至關重要。

研究小組發(fā)現(xiàn)，90%的基因融合在癌癥中不起重要作用。當從患者腫瘤的基因組序列推斷癌癥的原因時，應該考慮這些結果。

來自Wellcome Sanger研究所的共同第一作者Gabriele Picco博士說：

大多數(shù)基因融合對癌細胞的存活不是必需的。隨著基因組測序患者的腫瘤變得越來越普遍，在考慮特定基因融合是否會導致癌癥時，那些解釋數(shù)據(jù)的人必須小心謹慎。“

來自Wellcome Sanger研究所和開放目標的主要作者Mathew Garnett博士說：“我們發(fā)現(xiàn)了一些基因融合，這些都是癌癥存活的關鍵。這些基因改變可能為現(xiàn)有藥物治療患者提供機會，或者可能成為藥物未來的目標。我們發(fā)現(xiàn)了一種新的基因融合體YAP1-MAML2，它為包括卵巢癌在內的多種癌癥提供了新的藥物靶點。“研究人員還發(fā)現(xiàn)了一種新的融合體YAP1-MAML2，它對多種癌癥類型(如腦癌和卵巢癌)的進展至關重要。

結果還表明，涉及RAF1，ROS1和BRD4的基因融合可以被現(xiàn)有藥物靶向，這意味著可以為患有罕見亞型胰腺癌，乳腺癌和肺癌的患者提供新的治療選擇。

Julio Saez-Rodriguez博士，曾任EMBL-EBI和Open Targets，現(xiàn)居海德堡大學，他說：

癌癥在人與人之間存在差異，對這些差異的基因組觀點正在增加我們對癌癥的理解并為患者開放治療方案。這項研究提供了進一步利用基因融合作為治療生物標記物的機會，并將患者分層進入臨床試驗，可能提供更有針對性和有效的臨床研究。“

Sanger，EMBL-EBI和開放目標合作伙伴GSK的研究人員之間的合作促進了這些研究成果轉化為新的治療方法。

該研究有助于構建癌癥依賴性地圖，這是未來癌癥精確治療的規(guī)則手冊。

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