基因調(diào)控多工具在DNA損傷后對基因組進行解密時起著關(guān)鍵作用
現(xiàn)在已經(jīng)證明,參與細胞中基因表達調(diào)控的幾乎每一步的蛋白質(zhì)復(fù)合物在清除RNA生成中潛在的交通擁堵方面發(fā)揮著關(guān)鍵作用。
RNA聚合酶II(RNAPII) - 從DNA模板產(chǎn)生RNA的酶 - 由于DNA模板的損傷而會卡住,必須清除這些果醬以恢復(fù)基因表達和正常細胞功能。新的研究表明,主要的調(diào)節(jié)復(fù)合物“Ccr4-Not”執(zhí)行這項任務(wù),在從DNA轉(zhuǎn)錄RNA期間與RNAPII相關(guān)聯(lián),并在RNAPII卡住時標記RNAPII,使DNA得以修復(fù),正常的細胞功能恢復(fù)。
描述賓夕法尼亞州立大學(xué)科學(xué)家研究的論文發(fā)表在2019年4月4日的“基因與發(fā)展”雜志上。
“正常的細胞功能依賴于有時被稱為'生物學(xué)的中心法則',”生物化學(xué)和分子生物學(xué)教授,賓夕法尼亞州立大學(xué)真核基因調(diào)控中心成員Joseph C. Reese說。“DNA中的基因被轉(zhuǎn)錄成RNA,而RNA又轉(zhuǎn)化為蛋白質(zhì),這些蛋白質(zhì)可以發(fā)揮細胞的功能。這是一個高度協(xié)調(diào)的過程,基因表達和蛋白質(zhì)周轉(zhuǎn)的精確控制決定了細胞功能。
“從開始到結(jié)束,Ccr4-Not復(fù)合物幾乎涉及這一過程的每一步。我們的新研究表明,這種復(fù)合物具有額外的功能,有助于在轉(zhuǎn)錄期間出現(xiàn)問題時保持正常的細胞功能。”
在從RNA轉(zhuǎn)錄RNA期間,RNAPII本身是由多個蛋白質(zhì)亞基組成的大型復(fù)合物 - 沿著DNA鏈行進,讀取ATCG序列并產(chǎn)生RNA的互補鏈。如果RNAPII遇到可能由紫外線輻射和其他來源引起的DNA損傷,它可能會卡住并阻止尾隨聚合酶完成基因的轉(zhuǎn)錄,類似于停滯的汽車如何阻止其后面的交通流動。如果無法清除這種堵塞,那么轉(zhuǎn)錄相同基因的多個RNAPII可能會開始堆積在一種交通阻塞中,從而阻止DNA被修復(fù)并阻礙細胞功能。
研究人員使用遺傳方法和重建生物化學(xué) - 一種方法,可以通過精確控制的方式添加,帶走和混合細胞過程的純化成分,以準確識別它們的功能 - 以顯示Ccr4-Not新因素使用稱為遍在蛋白的小信號分子標記RNAPII。遍在蛋白與RNAPII的連接觸發(fā)其他細胞組分降解酶,清除果醬。“清除卡住的RNAPII是正常細胞功能的必要過程,”里斯說。“這種途徑的缺陷與許多疾病和人類綜合癥有關(guān),例如Cockayne綜合征 - 一種神經(jīng)退行性疾病,導(dǎo)致生長障礙,神經(jīng)發(fā)育缺陷和對紫外線的敏感性。”
“以前的研究表明Ccr4-Not可以幫助細胞應(yīng)對DNA損傷,”Reese說。“Ccr4-Not復(fù)合物的突變成員使細胞對破壞基因組的試劑更敏感,但由于Ccr4-Not涉及基因調(diào)控的許多方面,因此直到現(xiàn)在還不清楚它的確切作用是什么。 Ccr4-Not招募了RNAPII的破壞機制是一個令人驚訝的結(jié)果,并表明它可以作為拖車來消除整個基因組中的交通擁堵。“
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