爆炸的已知生命形式的數(shù)量
昆士蘭大學研究人員的一項卓越努力使已知基因組的數(shù)量增加了近10%。昆士蘭大學化學與分子生物科學學院ARC未來研究員Gene Tyson教授表示,研究人員從環(huán)境樣本中獲得了7280種細菌和623種古細菌基因組(來自微生物的遺傳物質(zhì))。
這表示目前基因組庫中80,000個基因組的數(shù)量增加了近10%。“這些基因組的真正價值在于,許多基因組在進化上與先前恢復的基因組不同,”澳大利亞生態(tài)基因組學(ACE)副主任Tyson教授說。
“它們將細菌和古細菌基因組樹的進化多樣性提高了30%以上,并且是17種細菌和3種古菌門中的第一代。”泰森教授說,微生物多樣性仍有待發(fā)現(xiàn),顯微鏡下觀察到的大多數(shù)微生物在實驗室條件下不能修復。
“由于挑戰(zhàn)因素包括緩慢的生長速度,挑剔的生長要求以及需要交叉喂養(yǎng)其他物種,因此不到百分之一可培養(yǎng),”他說。然而,測序技術(shù)和計算技術(shù)的最新進展允許直接從環(huán)境樣品中回收微生物基因組,而不需要實驗室培養(yǎng)。
“大約8000個基因組的回收使我們更接近微生物世界的綜合基因組表現(xiàn),但也表明還有許多待發(fā)現(xiàn),”他說。ACE共同研究員Donovan Parks博士首次表示,科學擁有必要的工具,可以大量進入系統(tǒng)發(fā)育和代謝生活的多樣性。
“我們預計,處理存放在其他公共儲存庫中的環(huán)境樣本將為生命樹增加數(shù)萬個額外的微生物基因組,”他說。“在這項研究完成期間,已經(jīng)報道了大量研究,這些研究有來自不同環(huán)境的數(shù)十個或數(shù)百個進化上不同的基因組。
“從環(huán)境樣本中獲取基因組的工具正在不斷改進,我們希望對本研究中考慮的樣本進行再處理將導致其他基因組的恢復。”“構(gòu)建微生物多樣性的綜合基因組庫為進一步了解微生物在關(guān)鍵生物地球化學和工業(yè)過程中的作用奠定了基礎(chǔ)。”
該研究還涉及ACE研究人員導演Phil Hugenholtz教授,Christian Rinke博士,Maria Chuvochina博士,Pierre-Alain Chaumeil博士,Ben Woodcroft博士和Paul Evans博士,發(fā)表在Nature Microbiology上。
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