定量完整的人類蛋白質(zhì)組

在期刊Cell中報(bào)道系統(tǒng)生物學(xué)研究所(ISB)的高級研究科學(xué)家Ulrike Kusebauch博士介紹了ISB，蘇黎世聯(lián)邦理工學(xué)院和其他一些研究機(jī)構(gòu)合作開發(fā)人類SRMAtlas的結(jié)果，這是一個(gè)蛋白質(zhì)組學(xué)分析的概要。任何人類蛋白質(zhì)。人類SRMAtlas是高度特異性質(zhì)譜分析的概要，用于預(yù)測人類蛋白質(zhì)組中任何蛋白質(zhì)的靶向鑒定和可重復(fù)定量，包括許多剪接變體，非同義突變和翻譯后修飾的分析。使用稱為選擇反應(yīng)監(jiān)測的技術(shù)，使用166,174個(gè)充分表征的化學(xué)合成的蛋白質(zhì)型肽開發(fā)了測定法。

SRMAtlas資源可在http://www.srmatlas.org免費(fèi)公開獲取，同樣有益于集中，假設(shè)驅(qū)動(dòng)和大型蛋白質(zhì)組規(guī)模研究。我們期望這種資源將顯著推進(jìn)基于蛋白質(zhì)的實(shí)驗(yàn)生物學(xué)，以了解疾病轉(zhuǎn)變和健康軌跡，因?yàn)槿魏稳祟惖鞍踪|(zhì)現(xiàn)在原則上都可以在任何樣本中被識別和量化。

在任何組織或細(xì)胞類型中可靠且可重復(fù)地測量人類蛋白質(zhì)組的任何蛋白質(zhì)的能力是變革性的，用于理解系統(tǒng)水平特性以及生理學(xué)和疾病中的特定途徑。在ISB的羅伯特莫里茨教授的實(shí)驗(yàn)室中，通過稱為選擇反應(yīng)監(jiān)測(簡稱SRM)的方法，協(xié)作努力生成并驗(yàn)證了高度特異性靶向蛋白質(zhì)組學(xué)分析的綱要，現(xiàn)在提供了20,277個(gè)注釋的99.7%的量化。人體蛋白質(zhì)由廣泛可及，靈敏且穩(wěn)健的靶向質(zhì)譜法選擇反應(yīng)監(jiān)測，SRM。該人SRMAtlas提供確定的測定坐標(biāo)，其最終鑒定生物樣品中的相應(yīng)肽。

盡管2003年人類基因組計(jì)劃在創(chuàng)建所有人類基因庫存方面取得了成就，但大多數(shù)蛋白質(zhì)研究仍然集中在人類基因組繪制之前研究的相同的相對較小的蛋白質(zhì)子集上。為了超越這種停滯不前的蛋白質(zhì)組學(xué)研究方法，需要開發(fā)基本上每種人類蛋白質(zhì)的高度特異性檢測方法。有了人類SRMAtlas這樣的資源，測量任何蛋白質(zhì)的前景現(xiàn)在都成了現(xiàn)實(shí)。人類SRMAtlas現(xiàn)在提供基于SRM技術(shù)的經(jīng)過驗(yàn)證的MS測定，所述SRM技術(shù)基于人蛋白質(zhì)組的基本上每種蛋白質(zhì)以統(tǒng)一且一致的方法開發(fā)。這些分析可以快速部署在系統(tǒng)生物學(xué)和生物醫(yī)學(xué)研究中，以高靈敏度和高選擇性鑒定和定量任何人類蛋白質(zhì)，

個(gè)性化醫(yī)療將依賴于分子特征來監(jiān)測健康狀況并提供信號以識別健康軌跡的變化并提供信息以使正確的患者與正確的藥物匹配，首先在臨床試驗(yàn)中，然后在臨床實(shí)踐中。人類SRMAtlas計(jì)劃將蛋白質(zhì)組學(xué)牢牢地推向了最前沿，并為蛋白質(zhì)組學(xué)提供了進(jìn)一步的彈藥，以在癌癥Moonshot日益全球化的努力中發(fā)揮重要作用。

鄭重聲明：本文版權(quán)歸原作者所有，轉(zhuǎn)載文章僅為傳播更多信息之目的，如有侵權(quán)行為，請第一時(shí)間聯(lián)系我們修改或刪除，多謝。

推薦內(nèi)容