解碼日本牽牛花的基因組
日本的研究人員成功解碼了整個日本牽?;ɑ蚪M。日本牽牛花(Ipomoea nil)是日本流行的傳統(tǒng)園林植物。夏天,您可以在許多日本花園中看到這朵花。此外,已知突變體由于稱為轉(zhuǎn)座子的“跳躍基因”的作用而經(jīng)常出現(xiàn)在牽?;ㄖ小慕瓚魰r代(約200年前)開始,已經(jīng)培育和欣賞了具有異形花朵和葉子的牽?;?,這已經(jīng)發(fā)展成為日本獨特的園藝文化。由于這些“突變體牽?;?rdquo;的流行,已經(jīng)收集了許多天然突變體。在現(xiàn)代,通過詳細分析這些突變體,
該研究小組破譯了日本牽?;藴示€的整個基因組。其中一位研究負責人,Keio大學的Yasubumi Sakakibara教授負責本研究中的基因組裝配和生物信息學分析,他說“ 獲得了高質(zhì)量的幾乎完整的基因組序列,從而確定了編碼序列大約四萬三千個牽?;ɑ?,以及產(chǎn)生各種牽?;伾托螤畹霓D(zhuǎn)座子的數(shù)量和分布。“
研究小組使用整個基因組序列來表征突變體,這些突變體顯示出具有深綠色,厚實和皺紋葉子的侏儒癥。他們確定了植物激素生物合成的基因,該基因被突變體中的轉(zhuǎn)座子破壞。
九州大學講師,國家生物資源項目(NBRP)牽?;ǖ墓善苯?jīng)理Eiji Nitasaka說:“隨著基因組的解碼,使用日本牽?;ㄗ鳛槟J缴锏膬r值急劇增加。我希望日本的牽?;捌渫蛔凅w將被世界各地的許多研究人員使用。“ 這項研究的領導者之一,國立基礎生物學研究所助理教授Atsushi Hoshino說:“ 日本牽?;ǖ幕蚪M序列不僅有助于理解牽?;ū旧恚€將用于研究與甘薯等密切相關的作物。“ 該研究發(fā)表在Nature Communications上。
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