采樣物種的DNA蹤跡導(dǎo)致更好的環(huán)境監(jiān)測
科學(xué)家正在利用一種技術(shù)來判斷一個物種是否僅僅從一個水樣中過去,正在開發(fā)評估生態(tài)系統(tǒng)的新方法。所有動物在生命中都會脫落DNA片段 - 糞便,粘液,精子和卵子,脫落皮膚,頭發(fā),最終還有它們的尸體。這些遺傳物質(zhì)的痕跡可以在環(huán)境中持續(xù)一段時間 - 在水中持續(xù)數(shù)周,在土壤中持續(xù)數(shù)百年。利用新的,更靈敏的DNA擴增和測序技術(shù),科學(xué)家們可以收集和分析水和土壤樣品中的這些碎片,并識別經(jīng)過的個體物種。
環(huán)境DNA或eDNA正在尋找實際用途的一個領(lǐng)域是環(huán)境評估,例如在進(jìn)行建筑工程之前檢查是否存在任何受保護(hù)物種。英國的Defra已經(jīng)批準(zhǔn)使用eDNA取樣來評估池塘中受保護(hù)的大鳳頭蠑螈的存在。
現(xiàn)在,在倫敦帝國理工學(xué)院和環(huán)境生態(tài)咨詢公司湯姆森生態(tài)學(xué)的新合作伙伴關(guān)系中,科學(xué)家們希望擴大eDNA的使用范圍。他們希望制定協(xié)議,以評估不同地區(qū)是否是重要保護(hù)物種的家園,包括小龍蝦,水田鼠,水獺和爬行動物。
除了查看關(guān)鍵保護(hù)物種進(jìn)行保護(hù)外,該團(tuán)隊還希望通過識別入侵物種,將eDNA用于生物安全。例如,除了本地小龍蝦外,一些英國水域還被侵入性美國信號小龍蝦占據(jù),這種小龍蝦勝過本地物種并破壞當(dāng)?shù)丨h(huán)境。對入侵小龍蝦的早期檢測可能意味著它們會得到更快的處理,并造成更少的損害。
最終,研究人員希望能夠使用eDNA來描繪整個生態(tài)系統(tǒng),分析水樣以獲得當(dāng)?shù)丨h(huán)境中存在的已經(jīng)脫落DNA的所有生物的快照。
正在帝國生命科學(xué)系攻讀博士論文的維多利亞普里斯特利說:“我認(rèn)為eDNA調(diào)查代表了我們?nèi)绾芜M(jìn)行物種調(diào)查和監(jiān)測的巨變。
“全球的eDNA研究付出了很多努力,一旦它變得更加成熟,我們應(yīng)該能夠更快地評估一個地區(qū)的物種。最終我們應(yīng)該能夠用它來創(chuàng)造更清晰,更多全球生物多樣性的詳細(xì)圖片。“
有效的環(huán)境評估
目前,物種的評估基于密集的實地調(diào)查,需要分類學(xué)專業(yè)知識,并經(jīng)常涉及標(biāo)記動物和重復(fù)訪問現(xiàn)場。然而,帝國生命科學(xué)系的Vincent Savolainen教授正在為各種物種開發(fā)新的方案。
這為更簡單,更具成本效益的環(huán)境評估調(diào)查鋪平了道路。薩沃萊寧教授說:“這項研究將有助于制定新的指數(shù),以實現(xiàn)生物多樣性和生態(tài)系統(tǒng)服務(wù)政府間科學(xué)政策平臺(IPBES)的目標(biāo),該機構(gòu)評估生物多樣性的狀況及其為社會提供的生態(tài)系統(tǒng)服務(wù),響應(yīng)決策者的要求。“
雖然測序技術(shù)在過去幾十年中有了顯著改善,但在分析eDNA方面仍存在挑戰(zhàn)。片段隨著時間的推移而降解,這一過程由溫度,微生物,酶和鹽度增強。
eDNA從物種到物種,從個體到個體“脫落”的比率也需要更多的研究,掠食者在不同地點之間移動eDNA的作用,特別是eDNA如何在水生環(huán)境中分布。
然而,普里斯特利認(rèn)為eDNA調(diào)查有一個光明的未來:“在整個生態(tài)系統(tǒng)eDNA監(jiān)測是標(biāo)準(zhǔn)做法之前還有一段路要走,但我相信至少在不久的將來,eDNA將越來越成為其中一種選擇在調(diào)查工具包中,與傳統(tǒng)方法一起以最有效的方式獲得最佳生態(tài)調(diào)查數(shù)據(jù)。“
積極的伙伴關(guān)系
自然科學(xué)學(xué)院院長湯姆韋爾頓教授說,像這樣的合作伙伴關(guān)系有助于將研究轉(zhuǎn)化為現(xiàn)實世界的應(yīng)用:“這項激動人心的合作表明,帝國的整個自然科學(xué)研究,即使是在蠑螈,也有實際應(yīng)用對現(xiàn)實世界的問題。
“我們與湯姆森生態(tài)學(xué)的合作將使我們的研究對環(huán)境保護(hù)和保護(hù)產(chǎn)生積極影響。”
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