25個(gè)基因組項(xiàng)目
為了紀(jì)念Wellcome Trust Sanger Institute于2018年年滿25歲,該研究所及其合作者正在對英國25種新的物種基因組進(jìn)行測序。最近的五個(gè)物種現(xiàn)已被全球數(shù)以千計(jì)的學(xué)童和公眾選中,他們參與了25個(gè)基因組項(xiàng)目的在線投票。該項(xiàng)目可以揭示為什么一些褐鱒遷移到開闊的海洋,而其他人則沒有,或者告訴我們更多關(guān)于知更鳥眼中的磁感受器,讓他們“看到”地球的磁場。它還可以解釋為什么紅松鼠容易受到松鼠痘病毒的攻擊,但灰松鼠可以攜帶并傳播病毒而不會(huì)生病。所有結(jié)果都將公之于眾,并將導(dǎo)致未來的研究,以了解英國的生物多樣性,并幫助保護(hù)和了解這些物種。
桑格研究所由Sir John Sulston教授于1993年創(chuàng)立,作為人類基因組計(jì)劃的一部分。該研究所對第一個(gè)人類基因組的金標(biāo)準(zhǔn)序列作出了最大的單一貢獻(xiàn),該序列于2003年出版.基因組是生物體用DNA編寫的完整遺傳指令集。每個(gè)基因組都包含構(gòu)建該生物體并使其生長和發(fā)育所需的所有信息。
自人類基因組標(biāo)志性建成以來,桑格研究所已成為全球公認(rèn)的基因組學(xué)領(lǐng)域的領(lǐng)導(dǎo)者。許多更重要的參考基因組已經(jīng)被測序 - 從小鼠和斑馬魚基因組到豬,大猩猩,蚊子和許多其他基因組。除動(dòng)物物種外,傳染病和細(xì)菌在參考基因組列表中也占有突出地位,從沙門氏菌和MRSA到衣原體和瘧疾。所有這些都提供了關(guān)于這些物種在健康和疾病方面的重要見解。
現(xiàn)在,桑格研究所及其合作伙伴正在全面測序來自英國的25種物種。該項(xiàng)目對一項(xiàng)更大規(guī)模的工作做出了很小的貢獻(xiàn),來自世界各地的科學(xué)家們聚集在一起制定了一個(gè)計(jì)劃,對地球上的所有生命進(jìn)行排序。
PacBio®長讀序列技術(shù)使該項(xiàng)目成為可能,該技術(shù)可生成高質(zhì)量的基因組。該研究所正在與PacBio和其他技術(shù)領(lǐng)域的領(lǐng)導(dǎo)者10x Genomics和Illumina合作,以創(chuàng)建這些基因組的最全面的視圖。
高質(zhì)量的基因組將為科學(xué)家們利用這些信息打開大門,研究人員可以發(fā)現(xiàn)英國物種如何應(yīng)對環(huán)境壓力,以及他們在遺傳學(xué)中保持什么秘密,使他們能夠蓬勃發(fā)展或掙扎。
根據(jù)它們所具有的品質(zhì),這25種物種分為五類:蓬勃發(fā)展,英國種類繁多; 瀕臨滅絕,瀕危和衰退的物種; 危險(xiǎn),入侵和有害物種; 我們都認(rèn)識(shí)到的標(biāo)志性的,典型的英國物種; 隱秘的物種,僅憑外觀,看不見或與其他物種無法區(qū)分。
將對其基因組進(jìn)行測序的25種物種是:
蓬勃發(fā)展的物種:
灰松鼠
小環(huán)蝴蝶
羅塞爾的布什 - 板球
牛津狗舌草
萎靡的物種:
紅松鼠
水田鼠
龜鳩
北二月紅色石蠅
危險(xiǎn)物種:
巨人Hogweed
印度苦瓜
King Scallop,也被稱為Great Scallop,Coquilles Saint-Jacques
新西蘭扁蟲
標(biāo)志性物種:
金鷹
黑莓
歐洲羅賓
紅梅森蜜蜂
隱秘物種:
褐鱒魚
普通Pipistrelle蝙蝠
Carrington的Featherwort
夏天松露
公眾選擇的五種:
常見的海星
芬筏蜘蛛
小斑點(diǎn)Catshark
亞洲大黃蜂
歐亞水獺
Wellcome Trust Sanger研究所所長Mike Stratton教授說:“二十五年前,基因組學(xué)領(lǐng)域是一個(gè)萌芽的想法,其意義只是夢想的。今天,基因組學(xué)和生物數(shù)據(jù)的現(xiàn)實(shí)是它正在改變我們的理解,疾病的診斷和治療,從癌癥和心臟病到瘧疾和感染。推動(dòng)這一發(fā)現(xiàn)時(shí)代的科學(xué)和技術(shù)正在加速我們對人體的理解,也加速了我們對周圍世界的理解。
這個(gè)項(xiàng)目是在世界各地進(jìn)行了許多深思熟慮的對話之后,關(guān)于我們這個(gè)星球上有多少物種在未來幾十年內(nèi)可以進(jìn)行排序 - 原則上,所有這些都是如此。我們正在著手為地球上的所有生命做出貢獻(xiàn)。“
Wellcome Trust Sanger研究所副主任Julia Wilson博士說:“通過對這25個(gè)基因組進(jìn)行測序,科學(xué)家將更好地了解英國物種,它們是如何到達(dá)這里的,它們的進(jìn)化以及不同物種如何適應(yīng)不斷變化的環(huán)境結(jié)果可以揭示這些物種中隱藏的真相,并使科學(xué)界能夠了解我們的世界是如何在我們周圍不斷變化和發(fā)展的。我們希望以特殊的“桑格”方式慶祝桑格研究所成立25周年,我很高興看到25基因組計(jì)劃如何展開。“
Wellcome基因組校區(qū)公共參與負(fù)責(zé)人Ken Skeldon說:“讓公眾有機(jī)會(huì)選擇在25個(gè)基因組計(jì)劃中對哪些物種的基因組進(jìn)行測序,這為該項(xiàng)目帶來了新的視角。我們很高興看到這么多人與學(xué)校的孩子在英國及以后積極參與了與科學(xué)家們在線聊天和投票最后五種。”
自然歷史博物館生命科學(xué)負(fù)責(zé)人蒂姆·利特伍德說:“自然歷史博物館很榮幸能與桑格研究所合作慶祝他們的25歲生日,并慶?;蚪M測序等分子技術(shù)可以帶來的進(jìn)步。研究英國野生動(dòng)物。我們關(guān)注的8000萬個(gè)標(biāo)本來自世界各地,擁有豐富的遺傳信息,使我們能夠開展創(chuàng)新研究,應(yīng)對全球挑戰(zhàn)。特別歡迎以最先進(jìn)技術(shù)關(guān)注英國生物多樣性。
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