黑暗蛋白質(zhì)組的秘密
蛋白質(zhì)通常被稱為生命的基石,占普通人體重的15%左右,在體內(nèi)發(fā)揮著廣泛的基本功能??茖W(xué)家長(zhǎng)期以來一直在猜測(cè)黑暗蛋白質(zhì)組的性質(zhì),蛋白質(zhì)的區(qū)域是完全未知的,但CSIRO最近的一項(xiàng)研究已經(jīng)繪制了這些黑暗區(qū)域的邊界,使我們更接近于發(fā)現(xiàn)所有黑暗區(qū)域的完整結(jié)構(gòu)和功能。蛋白質(zhì)。
這項(xiàng)工作由CSIRO和Garvan研究所的數(shù)據(jù)可視化科學(xué)家Sean O'Donoghue博士領(lǐng)導(dǎo),今天在著名的美國(guó)國(guó)家科學(xué)院期刊上發(fā)表。隨著對(duì)三維蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的了解不斷擴(kuò)大,我們可以識(shí)別每種蛋白質(zhì)中與實(shí)驗(yàn)確定結(jié)構(gòu)的任何區(qū)域不同的區(qū)域,創(chuàng)造出“暗蛋白質(zhì)組”。
“這些黑暗區(qū)域不同于任何已知結(jié)構(gòu),因此無法預(yù)測(cè),”O'Donoghue博士說。“確定這些領(lǐng)域非常令人興奮,因?yàn)槲覀儸F(xiàn)在有一張地圖可以集中我們的研究工作。”“我們的地圖定義了蛋白質(zhì)知識(shí)邊緣的邊界。”
該研究已經(jīng)取得了一些令人驚訝的結(jié)果,包括真核生物中近一半的蛋白質(zhì)組是黑暗的并具有意想不到的特征,包括與分泌組織的關(guān)聯(lián),二硫鍵,低進(jìn)化保守性以及與其他蛋白質(zhì)的已知相互作用很少。這項(xiàng)工作將有助于未來的研究揭示剩余的黑暗蛋白質(zhì)組,揭示目前未知的生命分子過程。
它還可以提供對(duì)基于蛋白質(zhì)的疾病的了解,如癌癥,2型糖尿病和許多神經(jīng)退行性疾病,如帕金森病和阿爾茨海默氏癥。蛋白質(zhì)分子構(gòu)成了我們身體的許多主要元素,黑色蛋白質(zhì) - 結(jié)構(gòu)完全未知的蛋白質(zhì) - 在皮膚和頭發(fā)中含量豐富,以及產(chǎn)生唾液,精液和乳汁的腺體。
“黑暗的蛋白質(zhì)組無疑在人類健康以及生命科學(xué)的許多其他領(lǐng)域發(fā)揮著關(guān)鍵作用,”O'Donoghue博士說。“我們相信研究黑暗蛋白質(zhì)組將澄清未來的研究方向,因?yàn)榘滴镔|(zhì)的研究已經(jīng)在物理學(xué)方面做了。”
這一發(fā)現(xiàn)是利用CSIRO的免費(fèi)網(wǎng)絡(luò)工具Aquaria進(jìn)行的,該工具使用蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(kù)的數(shù)據(jù)為546,000個(gè)蛋白質(zhì)序列創(chuàng)建3D結(jié)構(gòu)模型。
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