中文字幕在线天|亚洲一区二区三区手机版|少妇中文字幕乱码亚洲影视|最好看的久久综合伊人



      

      
  

      

      
	
	

      

      



      

	
      

      
	
      
  	       
      
       中國基因網(wǎng)您的位置：首頁 >企業(yè)新聞 >        
      
  
      
		
      
			
      生物基因信息學(xué)相關(guān)的網(wǎng)站有哪些?比較權(quán)威好用的網(wǎng)站推薦
      
			
      
				2020-03-13 09:39:10
				?
			  來源：百度百科
			
      
		
      
				
		
      
			
      生物基因信息學(xué)相關(guān)的網(wǎng)站有哪些?比較權(quán)威好用的網(wǎng)站推薦。一起來看看都有哪些吧!
      

      生物信息學(xué)高度依賴于網(wǎng)絡(luò)。實際上，你需要的幾乎所有資源，都可以從網(wǎng)上下到。你需要關(guān)注你研究領(lǐng)域所需要的那些，而不是全部的資源。
      

      NCBI：持有INSDC的節(jié)點。網(wǎng)站上有核酸、蛋白、基因名、基因組名等等的搜索工具，以及BLAST序列比對搜索工具，PUBMED文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫，Taxonomy數(shù)據(jù)，COG蛋白家族庫等等。FTP可以下到它全部的數(shù)據(jù)庫，BLAST的單機(jī)程序，以及各種工具程序。
      

      EBI：和NCBI類似，歐洲搞的對等物。感覺EBI網(wǎng)站比NCBI要清楚簡潔。另外EBI網(wǎng)站整合了更多的工具，比如多序列比對。
      

      Uniprot：全蛋白庫。NCBI和EBI的蛋白庫來源于此。目前包括兩部分：SwissProt是人工校對過的，TrEMBL是自動校對的。
      

      Pfam：蛋白家族庫?？梢允褂门涮椎腍MMER進(jìn)行搜索。比BLAST能找到更遠(yuǎn)緣的東西，而且找到的東西是結(jié)構(gòu)域。
      

      Rfam：RNA的，類似Pfam。
      

      RDP：16S rRNA庫。除了序列，它還有一個基于K-mer naive Bayesian model的rdp classifier，可以對輸入序列進(jìn)行物種分類，效率和準(zhǔn)確性較直接使用BLAST更高。
      

      GreenGenes：也是16S庫，不過它只收集比較全的序列。它提供了一個16S的標(biāo)準(zhǔn)化比對，并基于這個東西搞了個物種分類工具。
      

      EMBOSS：一個工具包，提供了幾百個進(jìn)行序列操作的工具。
      

      BioPerl、BioPython：Perl和Python的生物學(xué)模塊。
      

      R：類似matlab的語言，有一大堆的生物學(xué)包。
      

      SOAP：華大基因搞的高通量測序工具包，有de-novo拼接的，有mapping的，還有一些后續(xù)分析的。
      

      bowtie：一個用于序列mapping的軟件。
      

      samtools：用于操縱、分析高通量序列mapping的結(jié)果。功能非常靈活，但有點復(fù)雜。
      

      fastx toolkit：用來操縱高通量測序序列的工具包。
      

      

      以上內(nèi)容來源網(wǎng)絡(luò)，若有需要，可以嘗試使用，希望對大家有所幫助!
      
			

			
        
      
			
      
            鄭重聲明：本文版權(quán)歸原作者所有，轉(zhuǎn)載文章僅為傳播更多信息之目的，如有侵權(quán)行為，請第一時間聯(lián)系我們修改或刪除，多謝。
			
      
			
			
      
        
      推薦內(nèi)容