追蹤非小細(xì)胞肺癌的演變
在非小細(xì)胞肺癌(NSCLC)患者中,有關(guān)腫瘤內(nèi)異質(zhì)性和癌癥基因組進(jìn)化的數(shù)據(jù)僅限于小型回顧性隊列研究。我們希望前瞻性地研究與臨床結(jié)果相關(guān)的腫瘤內(nèi)異質(zhì)性,并確定早期NSCLC中驅(qū)動程序事件和進(jìn)化過程的克隆性質(zhì)。
方法
在這項前瞻性隊列研究中,我們對系統(tǒng)治療前已切除的100例早期NSCLC腫瘤進(jìn)行了多區(qū)域全外顯子組測序。我們對327個腫瘤區(qū)域進(jìn)行了測序和分析,以定義進(jìn)化史,獲得克隆和亞克隆事件普查,并評估腫瘤內(nèi)異質(zhì)性與無復(fù)發(fā)生存率之間的關(guān)系。
結(jié)果
我們觀察到廣泛的腫瘤內(nèi)異質(zhì)性的體細(xì)胞拷貝數(shù)變化和突變。EGFR,MET,BRAF和TP53中的驅(qū)動程序突變幾乎總是克隆的。但是,在進(jìn)化的后期發(fā)生的異質(zhì)驅(qū)動程序改變在超過75%的腫瘤中發(fā)現(xiàn),并且在PIK3CA和NF1以及染色質(zhì)修飾,DNA損傷反應(yīng)和修復(fù)中涉及的基因中很常見。基因組加倍和持續(xù)的動態(tài)染色體不穩(wěn)定與腫瘤內(nèi)異質(zhì)性相關(guān),并導(dǎo)致驅(qū)動體細(xì)胞拷貝數(shù)改變的平行進(jìn)化,包括CDK4,F(xiàn)OXA1和BCL11A的擴增。拷貝數(shù)異質(zhì)性升高與復(fù)發(fā)或死亡的風(fēng)險增加相關(guān)(危險比,4.9; P = 4.4×10 -4),這在多變量分析中仍然顯著。
結(jié)論
通過染色體不穩(wěn)定性介導(dǎo)的腫瘤內(nèi)異質(zhì)性與復(fù)發(fā)或死亡的風(fēng)險增加相關(guān),這一發(fā)現(xiàn)支持染色體不穩(wěn)定性作為預(yù)后指標(biāo)的潛在價值。
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