研究人員表示人體是DNA突變的鑲嵌圖案
研究人員已經(jīng)發(fā)現(xiàn)人體中3萬億個細(xì)胞不是單個DNA序列的克隆,正如人們普遍認(rèn)為的那樣。相反,人體細(xì)胞含有大量改變的DNA,稱為突變。它們在“正常”組織內(nèi)繁殖以產(chǎn)生稱為“體細(xì)胞克隆”的組織碎片。這種現(xiàn)象的科學(xué)術(shù)語是鑲嵌現(xiàn)象。
由于DNA復(fù)制過程中發(fā)生的隨機錯誤,分裂細(xì)胞發(fā)生突變時會出現(xiàn)馬賽克DNA。由于諸如高能輻射之類的外部因素導(dǎo)致DNA損傷,也會發(fā)生許多突變。早期的研究已經(jīng)通過基因測序技術(shù)檢測了鑲嵌現(xiàn)象,針對個別組織的微觀位點中的特定基因。
然而,波士頓馬薩諸塞州綜合醫(yī)院的Gad Getz和他的團(tuán)隊決定使用已有的基因型 - 組織表達(dá)(GTEx)數(shù)據(jù)庫中的RNA序列,而不是依賴于微小樣本的DNA序列。GTEx的數(shù)據(jù)基于死于癌癥以外疾病的人的正常組織類型。
RNA可以反映DNA突變,因為它是從DNA模板合成的。然而,并非所有的DNA序列都被轉(zhuǎn)錄成RNA,所以我們只能通過研究RNA來錯過很多突變。此外,該項目中使用的大量樣本意味著科學(xué)家們有可能錯過在“正常”細(xì)胞中隱藏的非常小的鑲嵌現(xiàn)象中發(fā)現(xiàn)的獨特DNA變異。
通常,RNA轉(zhuǎn)錄本也含有大量噪音或不必要的序列,并且開發(fā)了一種稱為RNA-MuTect的特殊工具來識別體細(xì)胞突變,同時最大限度地減少假陽性。
健康的DNA也包含突變
轉(zhuǎn)向RNA研究使研究人員能夠?qū)s500個個體中從29種不同組織中采集的670??0個樣本進(jìn)行測序。令人驚訝的是,95%的健康個體具有至少一片馬賽克組織,其中40%的量相當(dāng)大。在5%的突變組織中發(fā)現(xiàn)了五種或更多種類型的突變。大多數(shù)這些突變并不顯著,但其中許多突變也見于癌組織。
科學(xué)家發(fā)現(xiàn),一些組織類型的馬賽克比以前的研究所預(yù)期的要少,但是更多的組織顯示出比以前所知的鑲嵌現(xiàn)象,甚至更深的組織,如腎臟,肌肉和肝臟。
這是第一項分析許多人體組織中正常細(xì)胞基因突變情況的研究。“
Keren Yizhak,主要作者
正如所料,突變率反映了環(huán)境暴露,與年齡相關(guān)的暴露以及組織的增殖速度。因此,暴露于煙霧,污染物和紫外線(皮膚,食道和肺)等因素的組織具有最高的鑲嵌率。來自歐洲的個體在暴露于陽光下的皮膚上有更多突變,但不是非洲裔美國人。
隨著時間的推移,突變在肺和皮膚等組織中堆積,這些組織活躍地分開并暴露于高濃度的誘變劑。因此,這些組織在45歲以上的人群中含有大量突變。在分化較慢或根本不分裂的更分化的組織中未見到這種情況。
突變意味著癌癥?
在最常見的突變基因中有一種稱為TP53,稱為“基因組的守護(hù)者”,它有助于修復(fù)受損的DNA。在癌細(xì)胞中發(fā)現(xiàn)了一些TP53突變。然而,這些突變本身不會產(chǎn)生癌癥;其他基因的其他突變必須在癌變實際發(fā)生之前發(fā)生。
正如研究人員Erin Pleasance評論的那樣,“我們所看到的是一些最早的癌前變化,然后會積累更多的突變。”其中只有少數(shù)可能最終變成癌癥。
由于本研究中使用的所有組織都是非癌性的,因此下一個挑戰(zhàn)是確定哪些突變是正常變異,哪些是致癌或產(chǎn)癌。這種差異化是開發(fā)早期癌癥檢測工具的重要因素。
“我們預(yù)計大多數(shù)這些克隆都不會成為癌癥;他們成長,但有可能在某個時候停止,“根據(jù)Getz說。
另一位研究人員Cristian Tomasetti已經(jīng)開發(fā)出分選技術(shù),將腫瘤細(xì)胞中的腫瘤DNA(“血液活檢”)中的腫瘤DNA分離到血液中,以檢測早期癌癥?,F(xiàn)在看來,一些被認(rèn)為是癌癥生物標(biāo)志物的突變也可能被非癌細(xì)胞排出。
該研究證實,健康的身體含有大量不同的DNA序列,包括一些被鑒定為癌癥的DNA序列。將需要更多的研究來確定如何區(qū)分癌癥突變與正常鑲嵌現(xiàn)象。
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