疾病的蛋白質(zhì)組學(xué)分析
在初診后5年內(nèi),只有四分之一的人被診斷出患有急性髓性白血病(AML)。為了提高存活率,德克薩斯州的研究人員創(chuàng)建了一個(gè)在線地圖集,用于識(shí)別和分類AML診斷中的蛋白質(zhì)特征。新的蛋白質(zhì)分類將幫助研究人員和臨床醫(yī)生為患有這種侵襲性癌癥的患者推薦更好的治療和個(gè)性化藥物。這項(xiàng)突破性研究于本周在Nature Biomedical Engineering上發(fā)表。
美國(guó)德克薩斯大學(xué)圣安東尼奧分校的共同資深作者Amina Qutub表示,AML發(fā)生在血液和骨髓中,并且“呈現(xiàn)出如此異質(zhì)的癌癥,通常被描述為不是一種疾病,而是一系列疾病”。
研究人員檢查了由于AML引起的癌細(xì)胞中發(fā)生的遺傳,表觀遺傳和環(huán)境多樣性。通過(guò)分析205例患者活組織檢查的蛋白質(zhì)組學(xué)篩選,他們開(kāi)發(fā)了一種名為MetaGalaxy的新計(jì)算方法,用于鑒定白血病的分子標(biāo)志,并根據(jù)細(xì)胞功能和途徑將蛋白質(zhì)特征分為154種不同的模式。
通過(guò)從血液和骨髓中的蛋白質(zhì)表達(dá)開(kāi)發(fā)每個(gè)白血病患者的定量圖譜的獨(dú)特鏡頭來(lái)接近這一挑戰(zhàn),而不僅僅是定性指標(biāo)和遺傳風(fēng)險(xiǎn)的標(biāo)準(zhǔn)鏡頭,該團(tuán)隊(duì)將能夠更精確地對(duì)患者進(jìn)行分類進(jìn)入風(fēng)險(xiǎn)群體并更好地預(yù)測(cè)他們的治療結(jié)果。“這些標(biāo)志類似于星座引導(dǎo)恒星導(dǎo)航的方式:它們提供了白血病蛋白質(zhì)變化的圖譜,”Qutub說(shuō)。
為了更好地理解蛋白質(zhì)組水平的AML標(biāo)志并與其他研究人員分享他們的工作成果,該團(tuán)隊(duì)建立了一個(gè)名為白血病蛋白質(zhì)組圖譜的門(mén)戶網(wǎng)站。該在線門(mén)戶網(wǎng)站為腫瘤學(xué)家和癌癥科學(xué)家提供了從一名患者到另一名患者研究AML蛋白表達(dá)模式所需的工具。它還為世界各地的研究人員提供新的白血病研究和新計(jì)算工具的線索。
由于許多基因突變不能被靶向,因此本研究中使用的蛋白質(zhì)組學(xué)分析和靶標(biāo)識(shí)別過(guò)程將加速治療靶標(biāo)的鑒定。它還推動(dòng)研究人員根據(jù)其獨(dú)特的蛋白質(zhì)特征為患者開(kāi)發(fā)個(gè)性化的聯(lián)合療法。
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