人類激酶的新計算模型可以為癌癥藥物開發(fā)提供見解
研究人員已經(jīng)開發(fā)出一種人類MEK1的計算模型,這種蛋白質(zhì)具有作為各種人類癌癥的藥物靶標(biāo)的潛力。
當(dāng)涉及細(xì)胞增殖的分子信號出錯時,癌細(xì)胞的發(fā)生和發(fā)展就會發(fā)生。MEK1在健康和癌細(xì)胞內(nèi)的信號傳導(dǎo)中起重要作用。雖然人們對MEK1在此類信號傳導(dǎo)事件中的關(guān)鍵作用了解很多,但科學(xué)家們?nèi)匀徊恢繫EK1的結(jié)構(gòu)特征導(dǎo)致其在這些事件中被激活。
據(jù)“化學(xué)信息與模擬雜志”報道,由Ashley McDonald和合作者Javin Oza領(lǐng)導(dǎo)的Cal Poly San Luis Obispo的一組研究人員開發(fā)了人類MEK1酶結(jié)構(gòu)的計算模型。
像MEK1這樣的蛋白質(zhì)的生化特征仍然特別具有挑戰(zhàn)性,因為它們經(jīng)歷了稱為磷酸化的修飾,其可以顯著改變蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)和功能。在MEK1的情況下,磷酸化激活酶并傳播信號用于細(xì)胞增殖。“由于我們不知道MEK1的結(jié)構(gòu),我們發(fā)現(xiàn)了其他具有相似特征和作用機制的蛋白質(zhì),”麥克唐納說。“使用這些結(jié)構(gòu)作為模板,我們可以構(gòu)建MEK1模型,然后根據(jù)我們的生物化學(xué)家合作者確定的關(guān)鍵特征驗證這些模型。”
“我們在理解磷酸化酶如MEK1的生物化學(xué)方面的差距部分是由于在獲得有用量的純活性酶方面存在技術(shù)挑戰(zhàn),”Oza說。“計算模型使我們能夠彌合這一差距,并提供了對癌細(xì)胞內(nèi)MEK1可能外觀的見解。”
這些對MEK1結(jié)構(gòu)的見解為開發(fā)可能具有癌癥治療潛力的新型抑制劑打開了大門。
麥克唐納說:“這項研究表明,將計算和實驗科學(xué)相結(jié)合,為難以研究的問題提供獨特見解是非常有希望的。”
現(xiàn)在有了活躍的MEK1模型,科學(xué)家們可以跟進實驗方法,發(fā)現(xiàn)蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)如何控制其功能。MEK1和類似酶的計算建模和生物化學(xué)表征的組合有可能為腫瘤特異性治療的藥物開發(fā)提供新的見解。
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