Orthosomycins與任何其他抗生素未使用的細(xì)菌核糖體位點結(jié)合
一個LMU團隊已經(jīng)證明,orthosomycins與細(xì)菌核糖體上的一個不被任何其他抗生素使用的部位結(jié)合。該發(fā)現(xiàn)可能導(dǎo)致藥劑對現(xiàn)有的多重耐藥細(xì)菌菌株有效。已經(jīng)對幾種不同類別的抗生素產(chǎn)生抗性并且目前沒有安全有效的替代療法的細(xì)菌病原體是一個穩(wěn)定增長的問題。因此,迫切需要新的抗菌藥物。生物化學(xué)研究表明,稱為orthosomycins的化合物可以為具有新型作用模式的抗生素的設(shè)計提供基礎(chǔ)?,F(xiàn)在,由LMU基因中心的Daniel Wilson博士領(lǐng)導(dǎo)的研究人員與康奈爾大學(xué)(紐約州伊薩卡市)的Scott Blanchard博士和伊利諾伊大學(xué)芝加哥分校的Yury Polikanov博士領(lǐng)導(dǎo)的團隊合作,由兩種orthosomycins與其靶標(biāo)形成的復(fù)合物,并提供了對其作用機制的額外見解。新發(fā)現(xiàn),PNAS為進(jìn)一步優(yōu)化這些用于抗多藥抗性細(xì)菌菌株的藥劑提供了基礎(chǔ)。
Orthosomycins具有相對延長的結(jié)構(gòu),但與許多其他抗生素一樣,它們與細(xì)菌核糖體結(jié)合。核糖體是負(fù)責(zé)蛋白質(zhì)合成的亞細(xì)胞細(xì)胞器,無論是細(xì)菌還是高等生物。因為在后者的有核細(xì)胞中發(fā)現(xiàn)的核糖體在某些方面與它們的細(xì)菌對應(yīng)物不同,抗生素可以抑制細(xì)菌蛋白質(zhì)的合成而不影響宿主蛋白質(zhì)的產(chǎn)生。“借助高分辨率低溫電子顯微鏡,我們已經(jīng)確定了細(xì)菌核糖體上兩種正霉素,evernimicin和阿維拉霉素的結(jié)合位點,”威爾遜研究小組成員,新研究的第一作者Stefan Arenz說。 。“結(jié)果顯示,它們都與一個不被任何其他類抗生素識別的部位相互作用。”
細(xì)菌核糖體由三個核糖體RNA(rRNA)分子組成,它們被折疊成復(fù)雜的形狀,并用作組裝超過50種不同蛋白質(zhì)的支架。Evernimicin和阿維拉霉素結(jié)合在一個rRNA中的兩個短雙鏈段之間的凹槽中,使得它們還與名為L16的特定核糖體蛋白相互作用。與具有聚集結(jié)合位點的區(qū)域中的突變不同,“這里的突變不能導(dǎo)致對任何其他種類的抗生素的交叉抗性,因為該位點僅由正霉素使用,”Arenz指出。使用熒光共振能量轉(zhuǎn)移(FRET)技術(shù)進(jìn)一步分析結(jié)合對核糖體功能的影響,使研究人員能夠確定orthosomycins如何抑制蛋白質(zhì)合成的延伸階段。
合成任何給定蛋白質(zhì)的藍(lán)圖編碼在信使RNA(mRNA)的核苷酸序列中。核糖體基本上通過將mRNA中的三核苷酸序列與所謂的轉(zhuǎn)移RNA(tRNA)上的核苷酸三聯(lián)體順序匹配而起作用,所述轉(zhuǎn)移RNA附著有適當(dāng)?shù)陌被帷?傮w結(jié)果是確定的核苷酸序列被翻譯成特定的氨基酸序列,即具有特定功能的蛋白質(zhì)。在此過程中,每個tRNA的一端必須首先與核糖體結(jié)合,以便另一端可以旋轉(zhuǎn)到細(xì)胞器活性中心的位置,以使新氨基酸與前一個氨基酸連接。“evernimicin / avilamycin結(jié)合位點部分重疊通常容納tRNA鉸鏈片段的區(qū)域,”Arenz解釋說。“因此,任何抗生素的先前結(jié)合都會阻止旋轉(zhuǎn)運動,并使核糖體停滯不前。”
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