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      深入了解病毒感染
      
			
      
				2018-12-07 14:59:31
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      一個成年人感染巨細胞病毒通常是無害的。然而,在懷孕期間,病毒可傳播給胎兒,造成畸形。一旦病毒入侵人體細胞,他們開始生產(chǎn)大量的病毒蛋白。這包括超過500種蛋白質(zhì)和肽,其中包括200年以前未知的科學。
      

      深入了解病毒感染
      

      這一發(fā)現(xiàn)是由一個新的生物信息學分析成為可能方法發(fā)達的病毒學Julius-Maximilians-Universitat維爾茨堡(JMU)在巴伐利亞,德國。Lars Dolken和弗洛里安·艾教授教授的團隊在《自然》雜志上發(fā)表了他們的方法的方法。新技術(shù)與醫(yī)學應(yīng)用相關(guān),因為知識的曲目病毒蛋白例如,用來逃避免疫系統(tǒng)抵抗感染或開發(fā)疫苗是至關(guān)重要的。
      

      JMU開發(fā)允許捕獲核糖體活動比以前更準確。蛋白質(zhì)和多肽都聚集在細胞的大量的核糖體。在病毒感染,核糖體合成蛋白質(zhì)需要復(fù)制的病毒。匯編指令是由特殊的信使分子,mrna。
      

      研究人員要求:生產(chǎn)蛋白質(zhì)和肽在細胞的核糖體,和在什么數(shù)量?這個概要文件如何改變由于病毒感染的壓力嗎?他們使用最先進的高通量測序方法解決這些問題,使用核糖體分析(Ribo-seq)。這些技術(shù)可視化核糖體的活動,所謂的翻譯流程,定期模式。
      

      “以前,很多誤差源時常常阻止翻譯事件的可靠檢測分析Ribo-seq數(shù)據(jù),”弗洛里安·艾說。更重要的是,在至少一半的mrna,短的開放閱讀框架(sORFs)之前已知的開放閱讀框(orf)。很難精確的測量數(shù)???,然而他們是一個重要的細胞調(diào)節(jié)機制尤其是處于壓力之下的人更難免犯錯。
      

      新的生物信息學方法,稱為價格,大大提高了翻譯活動的識別。“我們的方法能夠解決更復(fù)雜的情況下,例如重疊子或不尋常的起始密碼子,精度高。這允許我們確定所有翻譯領(lǐng)域全基因組與高精度第一次,”埃哈德教授解釋道。
      

      因此,JMU團隊發(fā)現(xiàn)了各種新的細胞和病毒多肽。此外,研究人員發(fā)現(xiàn)數(shù)百sORF肽mhc i有效地呈現(xiàn)在細胞表面的分子。“sORFs因此編碼抗原的一個新類可以被我們的免疫系統(tǒng),”Lars Dolken說。”因此,我們假設(shè)sORFs參與免疫控制機制特別是在病毒感染和壓力響應(yīng)。”所有這些發(fā)現(xiàn)開辟新天地,以更好地理解的影響病毒感染在有機體。
      

      價格對基礎(chǔ)研究方法將有強烈的影響。Ribo-seq方法已經(jīng)應(yīng)用在幾乎所有的領(lǐng)域近年來生物醫(yī)學研究。“價格現(xiàn)在使我們能夠分析所有現(xiàn)有的和未來的數(shù)據(jù)集在更大的深度和準確性大大提高,“Dolken說。他認為獲得太大它證明再度重新分析所有先前發(fā)表的實驗數(shù)據(jù)。
      

      使這一切成為可能,維爾茨堡科學家提供了分析工具,開源軟件在互聯(lián)網(wǎng)上。他們認為他們的方法將在廣泛的范圍內(nèi)使用,并成為國際標準分析Ribo-seq實驗。他們寫道,“我們確信,加強數(shù)據(jù)分析將提供基本的新見解在許多領(lǐng)域的生物醫(yī)學研究。”
      

      在病毒學,新方法可能有助于更好地理解巨細胞病毒。例如,我們?nèi)匀徊恢罏槭裁匆粋€感染病原體導致嚴重損害在一些尚未出世的孩子,或者移植受者,而其他人則沒有影響。
      
			

			
        
      
			
      
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