基因組測序有助于確定結(jié)核病爆發(fā)的終點(diǎn)

通過基因組測序，不列顛哥倫比亞大學(xué)的研究人員以及倫敦帝國理工學(xué)院的同事現(xiàn)在可以確定何時(shí)爆發(fā)結(jié)核病(TB)。

該研究是同類研究中的第一項(xiàng)，旨在證明基因組分析可用于確定結(jié)核病暴發(fā)何時(shí)結(jié)束-有價(jià)值的知識(shí)可幫助公共衛(wèi)生研究人員了解暴發(fā)的動(dòng)態(tài)并指導(dǎo)實(shí)時(shí)公共衛(wèi)生應(yīng)對(duì)。基因組分析涉及閱讀引起疾病的病原體的完整遺傳學(xué)說明，并使用該數(shù)據(jù)推斷誰可能感染了誰。通過尋找從不同人群中獲取的病原體之間共有的突變，研究人員可以發(fā)現(xiàn)其病原體之間的關(guān)系最為密切，表明存在潛在的傳播途徑。

UBC人口與公共衛(wèi)生學(xué)院助理教授，不列顛哥倫比亞省疾病控制中心的資深科學(xué)家詹妮弗·加迪(Jennifer Gardy)說：“宣布結(jié)束結(jié)核病暴發(fā)是一件困難的事情。” “由于導(dǎo)致結(jié)核病的細(xì)菌在引起疾病之前可以在人的肺中休眠數(shù)月甚至數(shù)年，因此我們無法得知我們剛剛診斷出的結(jié)核病病例是否是近期感染-這表明疫情仍在繼續(xù)-或該人是否在幾年前被感染。”

研究人員使用數(shù)學(xué)和統(tǒng)計(jì)技術(shù)評(píng)估了始于2008年5月的結(jié)核病暴發(fā)，并能夠確定每一次暴發(fā)病例何時(shí)被感染。這為公共衛(wèi)生官員提供了確定疾病傳播何時(shí)停止和疾病爆發(fā)何時(shí)結(jié)束的方法。在數(shù)據(jù)表明自2012年中以來沒有發(fā)生疾病傳播之后，他們得以宣布2015年1月爆發(fā)。

Gardy解釋說：“通過使用數(shù)學(xué)和統(tǒng)計(jì)領(lǐng)域的一系列技術(shù)，我們可以得出每次感染的估計(jì)時(shí)間。” “這些信息對(duì)于處理疫情的公共衛(wèi)生官員非常有用。應(yīng)對(duì)疫情需要大量的努力和資源，我們需要知道何時(shí)可以降低應(yīng)對(duì)措施。”

加迪說：“基因組學(xué)以前曾被用來監(jiān)測傳染病的爆發(fā)，但這是第一次有可能宣布復(fù)雜的結(jié)核病爆發(fā)。” “這確實(shí)為結(jié)核病控制領(lǐng)域打開了新的大門。”

這項(xiàng)研究發(fā)表在《微生物基因組學(xué)》上。

2011年，Gardy和她的同事們率先使用新興的基因組學(xué)科學(xué)解決了結(jié)核病的爆發(fā)。通過從爆發(fā)中的每位患者中讀取TB細(xì)菌的完整DNA序列，她的小組表明可以確定在爆發(fā)中誰感染了誰。這項(xiàng)新工作通過引入確定這些感染何時(shí)發(fā)生的新方法，擴(kuò)展了早期的研究。

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