提出了蛋白質復合物的周期表

今天發(fā)表在“ 科學”雜志上的蛋白質復合物周期表提供了一種新的方式來觀察蛋白質在自然界中可以構建的各種結構，接下來可能會發(fā)現(xiàn)這些結構，并預測如何設計出完全新穎的結構。該表由Wellcome Genome Campus和劍橋大學的研究人員領導的跨學科團隊創(chuàng)建，為進化和蛋白質工程研究提供了寶貴的工具。

幾乎每個生物過程都依賴于蛋白質以特定方式相互作用和組裝成復合物，并且許多疾病與復雜組裝中的問題相關。支持該組織的原則尚未完全了解，但通過定義蛋白質復合物進化的基本步驟，新的“周期表”提供了蛋白質組裝的系統(tǒng)，有序觀點，為理解生物功能提供了可視化工具。

“進化已經產生了各種各樣的蛋白質復合物，它看起來有點混亂，”以前來自惠康基因組校園和現(xiàn)在愛丁堡大學MRC人類遺傳學部門的Joe Marsh解釋道。“但如果你打破了蛋白質成為復合物的步驟，那么有一些基本規(guī)則可以解釋人們迄今為止觀察到的幾乎所有組件。”

不同的舞廳舞蹈可以看作是少數(shù)基本步驟的無窮無盡的組合。類似地，蛋白質復合物組裝的“舞蹈” 可被視為二聚化的無限變異(一個雙倍，變成兩個)，環(huán)化(一個形成三個或更多的環(huán))和亞基添加(兩個不同的蛋白質相互結合) 。因為這些是以一種相當可預測的方式發(fā)生的，所以它并不像你想象的那樣難以預測新蛋白質是如何形成的。

“我們正在為混亂的蛋白質復合物世界帶來大量的秩序，”劍橋大學卡文迪什實驗室的Sebastian Ahnert解釋說，他是一位經常糾纏生物問題的物理學家。“蛋白質可以繼續(xù)經歷這些簡單步驟的多次迭代，增加越來越多的復雜程度并產生各種各樣的結構。我們所做的是基于這些基本原則的分類，幫助人們處理復雜性。“

塞巴斯蒂安補充說，規(guī)則的例外情況本身就很有趣，正如正在進行的研究一樣。“通過分析已經通過實驗確定三維結構的成千上萬種蛋白質復合物，我們可以看到發(fā)生的裝配過渡中的重復模式 - 并且通過質譜的新數(shù)據，我們可以開始看到更大的圖像， “喬說。

“這項研究的核心工作是在理論物理和計算生物學方面，但如果沒有牛津大學同事的質譜工作，就不可能做到這一點，”歐洲生物信息學研究所研究組組長Sarah Teichmann補充道。 -EBI)和Wellcome Trust Sanger Institute。“這是跨學科研究極為有價值的另一個很好的例子。”

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