重建深人口中美洲和南美洲的歷史
我們報(bào)告全基因組古DNA從49個(gè)人形成四個(gè)平行時(shí)間橫斷面在伯利茲,巴西、中央安第斯山脈和南錐,每個(gè)可以追溯到至少9000年前∼。的祖先群體輻射迅速?gòu)脑缙诘膬蓚€(gè)分支,導(dǎo)致今天的印第安人。我們之前從未見(jiàn)過(guò)文檔兩個(gè)流北美和南美之間的基因流動(dòng)。影響中央安第斯山脈的∼4200年前,而另一解釋北美最古老的基因組之間的親和力與克洛維斯文化和最古老的中部和南部的美國(guó)人從智利,巴西,和伯利茲。然而,這并不是后來(lái)南美的主要來(lái)源,隨著其他古代個(gè)人來(lái)自血統(tǒng)沒(méi)有特定親和力Clovis-associated基因組,建議至少在9000年前開(kāi)始的人口置換,緊隨其后的是大量人口連續(xù)性在多個(gè)區(qū)域。
人類學(xué)
介紹
基因研究的現(xiàn)代和古代印第安人表明,絕大多數(shù)在美國(guó)非北極原住民源自祖先的齊次祖先的人口。這人口的多樣化17500 - 14600日歷年禮物(BP)(Moreno-Mayar et al .,2018 a
)分為兩個(gè)分支,被稱為“南方印第安人”或“祖先”(ANC-A)和“北部印第安人”或“B祖先”(ANC-B)(Moreno-Mayar et al .,2018 A
Raghavan et al .,2015
拉斯穆森et al .,2014
,2012年帝國(guó)等。
,斯蓋布et al .,2018
)。個(gè)人約會(huì)從Anzick∼12900 - 12700 BP與克洛維斯文化相關(guān)的網(wǎng)站在蒙大拿和ANC-A血統(tǒng),也很大程度反映在今天的中部和南部的美國(guó)人在古老的加州人。相比之下,ANC-B祖先嚴(yán)重代表在北美東部和古人從安大略西南部(斯蓋布et al .,2018
)。原始記錄的研究這兩個(gè)深血統(tǒng)適合模型完全ANC-A中部和南部的美國(guó)人的祖先(Rasmussen et al .,2014
,2012年帝國(guó)等。
)。然而,斯蓋布et al .(2018)
建議所有美國(guó)中部和南部港口大量比例的血統(tǒng)(至少每個(gè)∼30%)。
最近的分析也表明,一些組織在巴西和澳洲人分享更多的等位基因(新幾內(nèi)亞土著,澳大利亞人,安達(dá)曼群島島民)(Raghavan et al .,2015
Skoglund et al .,2015
來(lái)自中國(guó)北方的)和一個(gè)∼40000個(gè)基點(diǎn)個(gè)人(楊et al .,2017
)比其他中部和南部的美國(guó)人。這樣的模式表明,這些團(tuán)體并不完全來(lái)自一個(gè)同質(zhì)性,而是源于人口的混合物,其中,人口Y,生了一個(gè)獨(dú)特的澳洲人的親和力。值得注意的是,我們的研究包括數(shù)據(jù)從個(gè)人如拉做圣網(wǎng)站有顱形態(tài)被稱為“Paleoamerican”認(rèn)為,表示兩個(gè)不同的New-World-founding人口(馮Cramon-Taubadel et al .,2017
)。這里,我們直接測(cè)試的假設(shè)Paleoamerican顱形態(tài)與血統(tǒng)不同導(dǎo)致的其他印第安人(無(wú)論該人口Y或其他)。
本研究前,公布的數(shù)據(jù)來(lái)自中美洲和南美洲最后一年以上僅限于兩個(gè)低覆蓋率的基因組(Raghavan et al .,2015
)。在這里,我們報(bào)告全基因組數(shù)據(jù)從伯利茲49個(gè)人,巴西,秘魯,和南錐(智利和阿根廷),41歲以上1000年,每一次橫斷面開(kāi)始在10900 - 8600個(gè)基點(diǎn)(圖1;表S3)。獲得這些數(shù)據(jù),我們與政府機(jī)構(gòu)和土著人民合作,確定樣品,準(zhǔn)備從骨骼材料,提取DNA(Dabney et al .,2013
),生成單和雙鏈DNA庫(kù),其中大部分我們對(duì)待酶uracil-DNA糖基化酶(UDG)減少特征的古代DNA錯(cuò)誤(Gansauge和梅耶,2013
Rohland et al .,2015
)。我們?yōu)閙tDNA豐富,∼120萬(wàn)個(gè)snp(Fu et al .,2015
)和測(cè)序的豐富圖書館Illumina公司儀器(表S3;星方法)。我們結(jié)合古代和現(xiàn)在的數(shù)據(jù)來(lái)研究基因變化在過(guò)去的11000年。
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