對比｜燃石、諾禾 & 世和基因NGS-kits審評報告大解讀

2018年7月23日，NMPA（原CFDA）批準了廣州燃石醫(yī)學檢驗所有限公司的高通量檢測創(chuàng)新產(chǎn)品 “人EGFR/ALK/BRAF/KRAS基因突變聯(lián)合檢測試劑盒（可逆末端終止測序法）”的三類醫(yī)療器械產(chǎn)品的注冊—— “腫瘤NGS第一證”。

很快的，2018年8月13日，NMPA又批準天津諾禾致源“人EGFR/KRAS/BRAF/PIK3CA/ALK/ROS1基因突變檢測試劑盒（半導體測序法）” 的三類醫(yī)療器械產(chǎn)品上市。

燃石與諾禾致源NGS-Kits的相繼獲批，市場對世和基因、飛朔生物、華因康基因、艾德生物、華大基因的NGS產(chǎn)品也更為關注與期待。終于，2018年9月30日，在這舉國歡慶的節(jié)日來臨之際，NMPA也給基因檢測行業(yè)送上了一份厚厚的大禮——“EGFR/ALK/ROS1/BRAF/KRAS/HER2基因突變檢測試劑盒（可逆末端終止測序法）”終獲NMPA批準。

近日，CMDE公布了世和基因的審評報告，小編進行如下整理匯編。

▽世和、諾禾&燃石NGS-Kit數(shù)據(jù)對比

試劑組成

首先，諾禾產(chǎn)品主要組成成分包括文庫構(gòu)建試劑盒、文庫定量試劑盒、模板制備試劑盒、模板制備溶液盒、耗材盒、測序試劑盒、測序溶液盒，共計有7個子試劑盒。相比較，燃石與世和的盒子較為簡單，選擇將組分中的部分子試劑盒進行一類備案。

其次，世和與諾禾的配套軟件均按照III類器械進行注冊申報。其中，諾禾的NGS軟件已經(jīng)獲批，世和稍顯滯后，但也已在審評階段。而燃石按照II類申報，目前已經(jīng)注冊發(fā)補階段，順利的話年底可拿證。

適用機型

世和與燃石的盒子都是基于illumina平臺，適用機型系MiseqDx。據(jù)了解，此型號產(chǎn)品illumina公司在2014年即啟動進口注冊，剛剛獲得NMPA批準。諾禾的盒子是基于中山大學達安基因股份有限公司生產(chǎn)的DA8600，注冊證號：國械注準20143401961。

預期用途

本試劑盒用于定性檢測非小細胞肺癌（NSCLC）患者經(jīng)福爾馬林固定的石蠟包埋（FFPE）組織樣本中EGFR、ALK、ROS1、BRAF、KRAS、HER2基因的多種變異。其中，EGFR基因19外顯子缺失及L858R 點突變用于吉非替尼片及鹽酸?？颂婺崞陌殡S診斷檢測，T790M點突變用于甲磺酸奧希替尼片的伴隨診斷檢測；ALK基因融合和ROS1 基因融合用于克唑替尼膠囊的伴隨診斷檢測。

▽伴隨診斷用途的基因變異類型及相應的靶向藥物

▽未經(jīng)伴隨診斷驗證的基因突變類型

世和與燃石的伴隨診斷藥物相同，均為吉非替尼片、鹽酸?？颂婺?、奧希替尼以及克唑替尼。諾禾則未對?？颂婺徇M行伴隨診斷研究。

臨床研究

>>>>（一）與已上市試劑或金標準方法的比較研究

1、臨床機構(gòu)：中國醫(yī)學科學院附屬腫瘤醫(yī)院、南京醫(yī)科大學第一附屬醫(yī)院(江蘇省人民醫(yī)院)、首都醫(yī)科大學附屬北京胸科醫(yī)院共 3 家。

2、樣本例數(shù)：入組樣本為 960 例非小細胞肺癌樣本和 46 例良性組織干擾樣本，共計 1006 例有效樣本。陽性率95.43%。樣本類型為石蠟包埋組織。

本臨床試驗共檢測出 716 例基因變異陽性樣本，陽性率為 71.17％（其中 56 例含有大于 1 種基因變異，占陽性樣本數(shù)的 7.82％）。包括 EGFR 基因中 203 例 19 外顯子缺失突變陽性、 192 例L858R 突變陽性、 41 例 T790M 突變陽性、 47例 G719 位點突變陽性及 29 例 L861Q 突變陽性； ALK 基因中 57 例 ALK 基因融合陽性； ROS1 基因中 29 例 ROS1 基因融合陽性； BRAF 基因中 25 例 V600E 突變陽性； KRAS 基因中 97 例 G12 位點突變陽性及 20 例 G13 位點突變陽性；HER2 基因中 32 例 20 外顯子插入突變陽性。

▽考核試劑與對照試劑比對數(shù)據(jù)

3、不一致驗證：考核試劑與對比方法結(jié)果不一致的樣本共 19 例，主要分為兩方面原因：（1）8例為考核試劑檢測范圍超過對比方法；（2）11 例可能為不同檢測方法間的差異，其中 3 例為考核試劑檢測 HER2 20 外顯子插入陽性且突變比例已低于Sanger 測序最低檢測限；1 例為對比方法免疫組化檢測 ALK基因融合陽性但無法顯示具體融合形式；余下 7 例經(jīng) Sanger測序驗證，6 例結(jié)果與考核試劑一致，1 例結(jié)果與對比方法一致。

>>>>（二）與伴隨診斷試劑的比較研究

試驗目的：在一致性臨床研究基礎上，深入評估考核試劑與已經(jīng)充分聯(lián)合藥物臨床評價的伴隨診斷試劑的一致性。

1、EGFR

臨床機構(gòu)：中國醫(yī)學科學院腫瘤醫(yī)院、首都醫(yī)科大學北京胸科醫(yī)院，共計2 家臨床機構(gòu)。

樣本類型：入組樣本為比較研究（一）中已入組及部分新入組樣本，共入組 323 例 NSCLC FFPE組織樣本。

2、ALK基因

臨床機構(gòu)：中國醫(yī)學科學院附屬腫瘤醫(yī)院、南京醫(yī)科大學第一附屬醫(yī)院（江蘇省人民醫(yī)院）、首都醫(yī)科大學附屬北京胸科醫(yī)院共 3 家機構(gòu)。

樣本類型：入組樣本為比較研究（一）中已入組樣本，共入組 1006例 NSCLC FFPE 組織樣本。

3、ROS1基因

臨床機構(gòu)：中國醫(yī)學科學院腫瘤醫(yī)院及首都醫(yī)科大學北京胸科醫(yī)院 2 家臨床機構(gòu)。

樣本類型：入組樣本為（一）比較研究中已入組及部分新入組樣本，共入組 323 例NSCLC FFPE 組織樣本。

▽考核試劑與已上市CDx試劑比對數(shù)據(jù)

其中，針對EGFR19del及L858突變的，世和CDx選擇了Roche的cobas EGFR Mutation Test，注冊證號：國食藥監(jiān)械(進)字2014第3403340號。諾禾則選擇了凱杰Kit，注冊證號為國食藥監(jiān)械(進)字2014第3400761號。燃石則選擇cobas® EGFR Mutation Test v2。針對T790M位點，世和與燃石、諾禾致源選擇的對照品一致，均為Roche的Cobas V2。

針對ALK融合基因，世和基因與燃石、諾禾的選擇有所差異，燃石與諾禾選擇的均是Abbott的Kit，世和則選擇了Roche的VENTANA anti-ALK (D5F3) Rabbit Monoclonal Primary Antibody，注冊證號：國食藥監(jiān)械(進)字2014第3403115號。

針對ROS1融合基因，世和選擇與諾禾致源的相同，均為廈門艾德的Kit。注冊證號：國食藥監(jiān)械(準)字2014第3401514號。此試劑盒雖未獲得CNDA批準用于伴隨診斷，但在2017年初獲得了日本藥品和醫(yī)療器械管理局(PMDA)批準，成為全球首個ROS1靶向抑制劑克唑替尼(crizontinib)的伴隨診斷試劑。

>>>>（三）TKI 藥物療效相關的回顧性臨床研究

1、樣本例數(shù)：共入組有效病例 118 例，其中吉非替尼片 23 例、鹽酸?？颂婺崞?30 例、甲磺酸奧西替尼片 20 例、克唑替尼膠囊 40 例、鹽酸厄洛替尼片 5 例。

2、樣本類型：針對“與伴隨診斷試劑臨床研究”中考核試劑檢出的陽性樣本。