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      研究人員開發(fā)了一個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù) 以幫助鑒定細(xì)菌感染的關(guān)鍵基因
      
			
      
				2019-11-20 10:30:59
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			  來(lái)源：
			
      
		
      
				
		
      
			
      傳染病是由能夠進(jìn)入，定植和在宿主生物體內(nèi)生長(zhǎng)的病原微生物引起的，從而產(chǎn)生感染。近年來(lái)，細(xì)菌感染在全球范圍內(nèi)呈上升趨勢(shì)，但細(xì)菌致病機(jī)理的許多機(jī)制仍知之甚少?？紤]到以下事實(shí)，這是高度相關(guān)的，因?yàn)樾碌目刮⑸锆煼ǖ陌l(fā)展很大程度上是基于對(duì)這些感染背后機(jī)制的最新了解。由細(xì)菌基因編碼的蛋白質(zhì)負(fù)責(zé)成千上萬(wàn)的生化過程，這些過程對(duì)于病原體的有效繁殖至關(guān)重要。但是，許多研究表明，為了鑒定這些基因，需要有關(guān)感染宿主真實(shí)病例中細(xì)菌發(fā)生情況的體內(nèi)信息。體外研究，即 在實(shí)驗(yàn)室中用細(xì)胞和細(xì)菌培養(yǎng)物重建的那些，后來(lái)并不總是與體內(nèi)研究的數(shù)據(jù)相關(guān)。這是由于以下事實(shí)：產(chǎn)生感染所必需的病原細(xì)菌基因取決于所定植生物體的環(huán)境。
      

      研究人員開發(fā)了一個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù) 以幫助鑒定細(xì)菌感染的關(guān)鍵基因
      

      巴塞羅那自治大學(xué)生物化學(xué)和分子生物學(xué)系以及基因組調(diào)控中心(CRG)的一組研究人員創(chuàng)建了BacFITBase數(shù)據(jù)庫(kù)。根據(jù)體內(nèi)實(shí)驗(yàn)的結(jié)果，研究人員系統(tǒng)地表征了與宿主細(xì)胞入侵和感染有關(guān)的細(xì)菌基因。進(jìn)行的所有實(shí)驗(yàn)均基于一種名為轉(zhuǎn)座子誘變的技術(shù)，該技術(shù)將稱為轉(zhuǎn)座子的DNA片段轉(zhuǎn)移至生物體的致病基因，從而使其失活。這樣，就可以直接觀察到它們?cè)诟腥局械淖饔?，研究人員可以確定對(duì)于特定宿主生物感染哪些是必需的。因此，該數(shù)據(jù)庫(kù)將使鑒定目標(biāo)蛋白變得更加容易，這些目標(biāo)蛋白可幫助抵抗傳染病并加速新型抗菌劑的開發(fā)。
      

      該數(shù)據(jù)庫(kù)包含90,000多個(gè)條目，其中包含有關(guān)特定致病細(xì)菌基因及其在五個(gè)不同宿主物種中對(duì)體內(nèi)感染狀況的貢獻(xiàn)的信息。它包括有關(guān)總共15種細(xì)菌的信息(腸炎沙門氏菌，流感嗜血桿菌，化膿性鏈球菌，牙齦卟啉單胞菌的兩個(gè)變體，鳥分枝桿菌，大腸桿菌的三個(gè)變體，空腸霍亂弧菌，空腸彎曲桿菌，肺炎克雷伯氏菌，沙門氏菌和不動(dòng)桿菌parahaemolyticus)和五個(gè)模型脊椎動(dòng)物(牛，豬，母雞，小鼠和兔子)，并具有10種不同組織的信息。
      
			

			
        
      
			
      
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