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      新的真菌感染診斷方法可以對(duì)抗全球主要的健康風(fēng)險(xiǎn)
      
			
      
				2019-08-10 08:39:24
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      Westmead醫(yī)學(xué)研究所(WIMR)的一項(xiàng)新研究表明，雙重DNA條形碼可以幫助改善侵襲性真菌疾病的診斷，使患者能夠更快地獲得可能挽救生命的治療。
      

      新的真菌感染診斷方法可以對(duì)抗全球主要的健康風(fēng)險(xiǎn)
      

      早期檢測真菌病原體 - 負(fù)責(zé)疾病的特定真菌種類 - 對(duì)于確保患者快速獲得治療，預(yù)防并發(fā)癥至關(guān)重要。然而，目前的診斷方法耗時(shí)，復(fù)雜且并不總是準(zhǔn)確的，導(dǎo)致治療延遲和不適當(dāng)?shù)闹委?，增加了發(fā)病率和死亡率的風(fēng)險(xiǎn)。
      

      雙DNA 條形碼是一種用于鑒定真菌病原體的新興技術(shù)。它使用兩個(gè)獨(dú)特的DNA區(qū)域，這些區(qū)域?qū)γ糠N致病真菌物種都是特異性的- 主要條形碼區(qū)域，內(nèi)部轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)域(ITS)和二級(jí)條形碼區(qū)域，平移延伸因子1α(TEF1α)。
      

      從患者樣品中提取真菌DNA，然后將其“擴(kuò)增”或相乘以增加可用于測序的DNA量。DNA信息經(jīng)過數(shù)據(jù)挖掘，并與參考數(shù)據(jù)庫進(jìn)行比較以識(shí)別真菌病原體。
      

      盡管二級(jí)條形碼區(qū)域于2017年推出，但其影響和有效性迄今尚未得到評(píng)估。
      

      首席研究員Wieland Meyer教授說：“我們的研究首次比較了兩個(gè)條形碼區(qū)域的準(zhǔn)確性，并評(píng)估了ITS和TEF1α結(jié)合的有效性。
      

      “我們能夠正確識(shí)別所有引起疾病的真菌物種，從最常見的人類真菌病原體白色念珠菌到很少引起感染的物種。我們發(fā)現(xiàn)單獨(dú)的主要條形碼區(qū)域無法檢測到所有物種 - 但是，次要區(qū)域，以及兩者的結(jié)合，填補(bǔ)了這一空白。
      

      目前和可能的真菌ID技術(shù)，顯示參考DNA條形碼數(shù)據(jù)庫的核心作用和所有技術(shù)的優(yōu)缺點(diǎn)。交叉框表示缺少數(shù)據(jù)庫。DNA條形碼參考菌株是構(gòu)建譜庫的基礎(chǔ)。圖片來源：Westmead Institute
      

      “總體而言，我們發(fā)現(xiàn)兩種條形碼的組合能夠更準(zhǔn)確地識(shí)別真菌種類，特別是在單個(gè)條形碼系統(tǒng)無法識(shí)別的情況下。”
      

      侵襲性真菌病(IFD)，如新型隱球菌感染或曲霉菌病，對(duì)全球健康構(gòu)成日益嚴(yán)重的威脅，每年有超過160萬人死于IFD。新的感染繼續(xù)出現(xiàn)，例如新的多藥耐藥念珠菌(Candida，C.auris)，它具有快速傳播并在醫(yī)療環(huán)境中持續(xù)存在的能力。
      

      邁耶教授說：“確定導(dǎo)致感染的真菌類型將有助于我們更快地進(jìn)行適當(dāng)?shù)闹委?，減少傷害，并可能降低與IFD相關(guān)的死亡率。
      

      “它還可能改善與IFD相關(guān)的其他并發(fā)癥，例如耐藥性，以及IFD對(duì)患者和醫(yī)療保健系統(tǒng)可能產(chǎn)生的財(cái)務(wù)影響。
      

      “雖然我們現(xiàn)在知道雙DNA條形碼系統(tǒng)在鑒定真菌物種方面更有效，但我們需要增加參考序列數(shù)據(jù)庫中可用序列的數(shù)量，以最大化我們可以識(shí)別的物種數(shù)量。
      

      “我們現(xiàn)在要求世界各地的研究人員提交可用于鑒定真菌病原體的參考序列。
      

      “通過改進(jìn)我們的數(shù)據(jù)庫，反過來，提高我們使用雙DNA條形碼的能力，我們將能夠?qū)⒃\斷周轉(zhuǎn)時(shí)間從幾天或幾周減少到不到24小時(shí)，這可能會(huì)對(duì)患者的結(jié)果產(chǎn)生重大影響，并有可能挽救生命。“
      
			

			
        
      
			
      
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