DNA梯子用于DNA研究的廉價(jià)分子標(biāo)尺
新的免許可DNA梯子將允許研究人員估算DNA片段的大小,而成本僅為現(xiàn)有方法的一小部分。由賓夕法尼亞州立大學(xué)生物化學(xué)與分子生物學(xué)教授Song Tan和前大學(xué)生Ryan C. Henrici領(lǐng)導(dǎo)的本科生研究小組開(kāi)發(fā)了兩種質(zhì)粒 - 一種圓形DNA - 可用DNA剪刀切割,稱(chēng)為限制酶,以創(chuàng)造DNA梯子。梯子可用于估計(jì)長(zhǎng)度在約50和5,000個(gè)堿基對(duì)之間的DNA片段的大小。2017年5月26日在科學(xué)報(bào)告期刊上發(fā)表了一篇描述該研究的論文。
“DNA梯子,也稱(chēng)為DNA分子量標(biāo)記,是分子生物學(xué)研究中最常用的試劑之一,”Tan說(shuō)。“它們用于任何需要凝膠電泳的應(yīng)用 - 一種根據(jù)DNA大小分離DNA片段的技術(shù)。我們希望將這些質(zhì)粒提供給研究界,以便以低成本生產(chǎn)高質(zhì)量的DNA分子量標(biāo)記物。 “
研究小組創(chuàng)建了兩種質(zhì)粒pPSU1和pPSU2,它們共同產(chǎn)生DNA梯子,增量為100或1,000堿基對(duì),具體取決于使用的限制酶。研究人員可以在他們自己的實(shí)驗(yàn)室中輕松地生產(chǎn)足夠的兩個(gè)梯子,以低于10美元的價(jià)格進(jìn)行1,000次使用。相比之下,商業(yè)上可獲得的DNA梯子價(jià)格在250美元到500美元之間。此外,與許多目前可用的DNA梯子不同,100堿基對(duì)梯子適用于瓊脂糖和聚丙烯酰胺凝膠,這兩種類(lèi)型通常用于分子生物學(xué)。
“我們也很高興pPSU質(zhì)??赡茉谌蚍秶鷥?nèi)用于進(jìn)一步研究和加強(qiáng)課堂實(shí)驗(yàn)室的科學(xué)教育,”Henrici說(shuō)。“這項(xiàng)技術(shù)每次使用的DNA梯度不到一美分,是使用商用DNA梯子的一小部分。”
用于生產(chǎn)賓夕法尼亞州立大學(xué)DNA梯子的pPSU1和pPSU2質(zhì)粒將通過(guò)Addgene和DNASU質(zhì)粒庫(kù)獲得非營(yíng)利性學(xué)術(shù)用戶的許可限制。
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