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      篩選技術(shù)檢測(cè)感知和響應(yīng)環(huán)境信號(hào)的特殊信使RNA分子
      
			
      
				2019-03-18 10:34:18
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      A * STAR的研究人員開發(fā)了一種快速，高通量的篩選程序，可以檢測(cè)RNA適體 - 特異性信使RNA分子(mRNA)，能夠感知和響應(yīng)特定的細(xì)胞化學(xué)物質(zhì) - 在從細(xì)胞中提取的正常mRNA的海洋中。該過程由新加坡A * STAR基因組研究所的Yue Wan領(lǐng)導(dǎo)的團(tuán)隊(duì)開發(fā)，稱為PARCEL或“暴露于配體結(jié)合的RNA構(gòu)象的平行分析”。萬希望該技術(shù)將成為基因調(diào)控研究的標(biāo)準(zhǔn)工具。
      

      篩選技術(shù)檢測(cè)感知和響應(yīng)環(huán)境信號(hào)的特殊信使RNA分子
      

      “PARCEL提供了一種非常快速的方法，可以在幾乎任何細(xì)胞類型中找到RNA適體，”她說。RNA適體是非常特異的：它們只通過與其結(jié)合來感知一種化學(xué)物質(zhì)，這可以改變它們的形狀。通過比較從存在或不存在目標(biāo)化學(xué)物質(zhì)的細(xì)胞中提取的mRNA分子的形狀，PARCEL可以發(fā)現(xiàn)能夠感知該化學(xué)物質(zhì)的少數(shù)mRNA 。
      

      Wan說，感覺到的化學(xué)物質(zhì)通常是在細(xì)胞生物化學(xué)中起重要作用的代謝物。迄今為止，PARCEL已經(jīng)發(fā)現(xiàn)了58種新的RNA適體 - 這是已知的少數(shù)天然RNA適體的重要補(bǔ)充。
      

      重要的是，先前已經(jīng)證明少數(shù)mRNA適體不僅可以感知代謝物，還可以啟動(dòng)反應(yīng)。這些被稱為核糖開關(guān)。“核糖開關(guān)告訴細(xì)胞'嘿，我感覺到了一種分子 - 所以現(xiàn)在就采取這種行動(dòng)'”，萬說。
      

      信使RNA分子通常攜帶從基因到細(xì)胞蛋白質(zhì)工廠的編碼“信息”，要求產(chǎn)生特定蛋白質(zhì)。因此，Wan指出，細(xì)胞的一個(gè)可能的作用是改變?cè)摰鞍踪|(zhì)的生產(chǎn)率。
      

      在PARCEL之前，使用計(jì)算方法在細(xì)菌中發(fā)現(xiàn)了核糖開關(guān)。但是已知很少有人存在于真核生物中，即具有細(xì)胞核的單細(xì)胞微生物。Wan和她的團(tuán)隊(duì)假設(shè)真核生物可能具有對(duì)關(guān)鍵代謝物 - 維生素B2敏感的核糖轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白。
      

      “維生素B2是一種非常重要的代謝產(chǎn)物，在細(xì)菌中有許多核糖開關(guān)對(duì)它有反應(yīng)。我們決定使用PARCEL在真核生物中篩選它們。”
      

      PARCEL在真核生物中揭示了兩個(gè)新的核糖開關(guān) - 特別是酵母細(xì)胞 - 根據(jù)維生素B2水平增加或減少蛋白質(zhì)產(chǎn)量，加上另一種細(xì)菌維生素B2核糖開關(guān)。
      

      Wan預(yù)計(jì)使用PARCEL將會(huì)帶來更多這樣的發(fā)現(xiàn)。
      
			

			
        
      
			
      
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