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      線粒體編碼熱帶根結(jié)線蟲(chóng)的基因組分析

      Meloidogyne屬的多食性孤雌生殖根結(jié)線蟲(chóng)被認(rèn)為是亞熱帶和熱帶農(nóng)業(yè)中最重要的線蟲(chóng)害蟲(chóng)。盡管對(duì)正確診斷至關(guān)重要,但鑒定這些病原體仍然存在問(wèn)題。根特大學(xué)(比利時(shí)),國(guó)家植物保護(hù)組織(荷蘭)國(guó)際熱帶農(nóng)業(yè)研究所(尼日利亞)的科學(xué)家對(duì)線蟲(chóng)的鑒定進(jìn)行了改進(jìn)。

      線粒體編碼熱帶根結(jié)線蟲(chóng)的基因組分析

      傳統(tǒng)上使用的診斷策略,包括形態(tài)測(cè)量學(xué),宿主范圍測(cè)試,生物化學(xué)和分子技術(shù),現(xiàn)在似乎是不可靠的,因?yàn)樽罱岢龅母Y(jié)線蟲(chóng)的雜種起源。為了確定這些病原體的合適條形碼區(qū)域,篩選了九個(gè)快速進(jìn)化的線粒體編碼基因。由此產(chǎn)生的單倍型網(wǎng)絡(luò)揭示了密切相關(guān)的譜系,表明最近的物種形成,通過(guò)農(nóng)業(yè)實(shí)踐的人為輔助分布,以及M. arenaria中網(wǎng)狀進(jìn)化的證據(jù)。盡管如此,核苷酸多態(tài)性具有足夠的變異來(lái)區(qū)分這些密切相關(guān)的譜系。

      此外,通過(guò)篩選來(lái)自廣泛地理來(lái)源和可變宿主的80個(gè)群體來(lái)驗(yàn)證譜系分選的完整性。重要的是,我們的結(jié)果表明,線粒體單倍型與傳統(tǒng)的酯酶同工酶模式密切相關(guān)并且一致,這表明使用線粒體單倍型可以可靠地鑒定不同的單性生殖譜系。該研究表明,條形碼區(qū)域Nad5可以可靠地識(shí)別熱帶根結(jié)線蟲(chóng)的主要譜系。

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