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      眾包平臺(tái)使公共基因表達(dá)數(shù)據(jù)更易獲取
      
			
      
				2019-01-19 11:07:26
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      來自美國國立衛(wèi)生研究院的國家過敏和傳染病研究所(NIAID)的科學(xué)家開發(fā)了一個(gè)免費(fèi)的在線平臺(tái)，該平臺(tái)使用眾包方法使生物醫(yī)學(xué)研究人員更容易獲得公共基因表達(dá)數(shù)據(jù)，而無需計(jì)算專業(yè)知識(shí)。他們?cè)?月20日的Nature Biotechnology在線期刊中描述了名為OMics Compendia Commons(OMiCC)的平臺(tái)。
      

      眾包平臺(tái)使公共基因表達(dá)數(shù)據(jù)更易獲取
      

      公共數(shù)據(jù)庫包含數(shù)百萬個(gè)基因表達(dá)譜 - 描述基因在某些條件下開啟或關(guān)閉程度的數(shù)據(jù)?？茖W(xué)家可能會(huì)重復(fù)使用這些數(shù)據(jù)來生成和解決新的研究問題。例如，研究人員可以重新設(shè)計(jì)一個(gè)數(shù)據(jù)集，比較來自藥物治療和未治療人群的血液樣本，以調(diào)查性別對(duì)治療的影響。然而，由于許多生物學(xué)家缺乏數(shù)據(jù)檢索，處理和分析所需的計(jì)算機(jī)編程專業(yè)知識(shí)，因此這些大量信息在很大程度上仍未被開發(fā)用于此類數(shù)據(jù)重用。此外，公共數(shù)據(jù)庫條目通常包含原始研究數(shù)據(jù)，需要對(duì)其進(jìn)行分析以進(jìn)行分析。
      

      OMiCC旨在利用眾包技術(shù)利用研究界的專業(yè)知識(shí)來克服這些挑戰(zhàn)。在平臺(tái)內(nèi)，用戶可以創(chuàng)建基因表達(dá)數(shù)據(jù)組，并通過使用標(biāo)準(zhǔn)化詞匯表分配參數(shù)(例如樣本類型和疾病)來“注釋”它們。OMiCC保存這些用戶創(chuàng)建的組和關(guān)聯(lián)的注釋，使其他人可以重復(fù)使用。
      

      在OMiCC中，用戶可以匯集這些數(shù)據(jù)組并分析來自多個(gè)研究的信息以搜索生物關(guān)系，這種統(tǒng)計(jì)方法稱為薈萃分析。NIAID科學(xué)家預(yù)計(jì)，隨著OMiCC用戶社區(qū)的發(fā)展，該平臺(tái)將發(fā)展成為一種豐富的資源，可以將越來越多的公共數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)化為新的生物學(xué)見解。
      
			

			
        
      
			
      
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