馬里蘭州貝塞斯達(dá)， 2015年9月30日 - 來自1000 Genomes Project Consortium的國際科學(xué)家團(tuán)隊(duì)創(chuàng)建了世界上最大的人類基因組差異目錄，為研究人員提供了強(qiáng)有力的線索，幫助他們確定為什么有些人容易受到各種各樣的影響。疾病。雖然人們的基因組中的大多數(shù)差異 - 稱為變體 - 是無害的，但有些是有益的，而其他則有助于疾病和病癥，從認(rèn)知障礙到癌癥，肥胖，糖尿病，心臟病和其他疾病的易感性。了解基因組變異如何導(dǎo)致疾病可能有助于臨床醫(yī)生開發(fā)改進(jìn)的診斷和治療，以及新的預(yù)防方法。

國家人類基因組研究所(NHGRI)是美國國立衛(wèi)生研究院(NIH)的一部分，幫助資助和指導(dǎo)這個(gè)在美國，英國，中國，德國和加拿大的研究人員的國際公私聯(lián)合體。

在2015年9月30日在線發(fā)表的兩項(xiàng)研究中，自然，調(diào)查研究2504人的基因組來自非洲，東亞和南亞，歐洲和美洲的26名人口。

在主要的自然研究中，研究人員發(fā)現(xiàn)人類基因組中有大約8800萬個(gè)不同的人群，建立了一個(gè)供研究人員使用的數(shù)據(jù)庫，作為人類和世界各地人類基因組構(gòu)成因素的標(biāo)準(zhǔn)參考。該目錄使人類基因組中已知變異位點(diǎn)的數(shù)量增加一倍以上，現(xiàn)在可用于人類生物學(xué)和醫(yī)學(xué)的廣泛研究，為重新理解DNA的遺傳差異如何導(dǎo)致疾病提供基礎(chǔ)風(fēng)險(xiǎn)和藥物反應(yīng)。

在確定的超過8800萬個(gè)可變位點(diǎn)中，約有1200萬個(gè)具有可能由許多人群共享的常見變異。該研究表明，最大的基因組多樣性存在于非洲人群中，與人類起源于非洲的證據(jù)以及來自非洲的遷移在世界各地建立其他人群相一致。

研究的26個(gè)種群包括尼日利亞的Esan等群體; 哥倫比亞人在哥倫比亞麥德林; 西班牙的伊比利亞人口; 漢語在北京; 和斯里蘭卡泰米爾人在英國。所有為該項(xiàng)目研究的人都同意廣泛發(fā)布他們的數(shù)據(jù)，這些數(shù)據(jù)可供世界各地的研究人員使用。

1000個(gè)基因組項(xiàng)目數(shù)據(jù)的更直接用途之一是用于全基因組關(guān)聯(lián)研究(GWAS)，其比較有和沒有疾病的人的基因組，以搜索包含與該疾病相關(guān)的基因組變體的基因組區(qū)域。這些研究通常發(fā)現(xiàn)幾種與疾病相關(guān)的基因組區(qū)域，并且在這些區(qū)域的每一個(gè)中都有許多變體?？茖W(xué)家現(xiàn)在可以將GWAS數(shù)據(jù)與更詳細(xì)的1000個(gè)基因組項(xiàng)目數(shù)據(jù)結(jié)合起來，更準(zhǔn)確地歸結(jié)于影響疾病的區(qū)域。研究人員可以使用1000個(gè)基因組計(jì)劃數(shù)據(jù)來查找與該疾病相關(guān)的那些區(qū)域中的大多數(shù)變異，而不是對研究中所有人的基因組進(jìn)行測序，而這仍然很昂貴。

“當(dāng)1000個(gè)基因組計(jì)劃于2008年首次啟動(dòng)時(shí)，對于稀有基因組變異如何在世界各地的人群中分布以及它們與其他變種之間的關(guān)系的了解并不多，”主要研究人員Adam Auton博士說。最近擔(dān)任紐約阿爾伯特愛因斯坦醫(yī)學(xué)院遺傳學(xué)助理教授的資深作者和首席研究員。

“該項(xiàng)目旨在建立基因組變異的參考數(shù)據(jù)集。它真實(shí)地告訴我們?nèi)祟惢蚪M變異和多樣性的結(jié)構(gòu)，”Auton博士說，他現(xiàn)在在加利福尼亞州山景城的23andMe公司工作。

在“ 自然”雜志的一篇同伴論文中，科學(xué)家研究了2,504個(gè)樣本中基因組結(jié)構(gòu)的差異。他們發(fā)現(xiàn)了近69,000個(gè)差異，稱為結(jié)構(gòu)變體。這些基因組差異，其中許多影響基因，包括缺失(DNA丟失)，插入(添加DNA)和重復(fù)(額外的DNA拷貝)。研究人員創(chuàng)建了一組可能導(dǎo)致疾病的八類結(jié)構(gòu)變異圖。

“結(jié)構(gòu)變異是造成人類基因組DNA差異的主要原因，”德國海德堡歐洲分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室基因組生物學(xué)研究組組長和歐洲研究委員會(huì)研究員Jan Korbel博士說。 。Korbel博士是結(jié)構(gòu)變異研究的資深作者和聯(lián)合首席研究員。“世界各地人口的這種廣泛代表性，從未研究過基因組結(jié)構(gòu)變異。”

Korbel博士，聯(lián)合首席研究員Evan Eichler，博士，基因組科學(xué)教授和華盛頓大學(xué)華盛頓大學(xué)霍華德休斯醫(yī)學(xué)研究所研究員及其同事發(fā)現(xiàn)結(jié)構(gòu)變異通常比他們原先認(rèn)為的更復(fù)雜。例如，大多數(shù)涉及DNA序列改變其在基因組中的方向的倒位經(jīng)常伴隨其他結(jié)構(gòu)變化而發(fā)生。

致密歇根大學(xué)安娜堡分校生物統(tǒng)計(jì)學(xué)主席GonçaloAbecasis博士和主要自然研究的聯(lián)合首席研究員，1000基因組項(xiàng)目的價(jià)值遠(yuǎn)遠(yuǎn)超出了數(shù)據(jù)。DNA測序和生物信息學(xué)的進(jìn)步對于完成該項(xiàng)目至關(guān)重要。

“我們已經(jīng)大量了解了如何大規(guī)模地進(jìn)行基因組學(xué)研究，”Abecasis博士說。“在1000個(gè)基因組項(xiàng)目的過程中，我們開發(fā)了新的，改進(jìn)的方法，用于大規(guī)模DNA測序，分析和解釋基因組信息，以及如何存儲(chǔ)這么多數(shù)據(jù)。我們學(xué)習(xí)了如何在不同的基因組研究中進(jìn)行背景和世界的一部分。“

“1000基因組計(jì)劃為其他人提供了回答真正有趣問題的基礎(chǔ)，”Auton博士說。“現(xiàn)在每個(gè)人都想知道這些變種告訴我們的人類疾病。”

許多組織，機(jī)構(gòu)和其他NIH研究所，包括國家癌癥研究所，國家心臟，肺和血液研究所和國家普通醫(yī)學(xué)研究所也為這項(xiàng)研究提供資金。