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      Axolotl基因組測(cè)序
      
			
      
				2018-12-15 09:04:09
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			  來(lái)源：
			
      
		
      
				
		
      
			
      一個(gè)國(guó)際研究小組成功地對(duì)墨西哥蠑螈(Ambystoma mexicanum)的基因組進(jìn)行了測(cè)序，組裝和分析，這是一種神秘的蠑螈類(lèi)生物，具有非凡的再生能力。
      

      Axolotl基因組測(cè)序
      

      Axolotls僅在墨西哥中部，墨西哥城的南部邊緣，在霍奇米爾科附近的運(yùn)河和濕地中聞名。它們并非在它們的范圍內(nèi)均勻分布，而是聚集在特定的地方。
      

      它們的平均長(zhǎng)度為9英寸(20厘米)，但長(zhǎng)度可達(dá)18英寸(45厘米)。
      

      Axolotls是新生的水生蠑螈，意味著它們?cè)诔赡?，繁殖狀態(tài)下保留了某些幼蟲(chóng)特征。它們具有從頭部后面延伸到通氣孔的尾鰭，并且永遠(yuǎn)不會(huì)丟失它們的鰓，使它們永久保持在水下。
      

      動(dòng)物也是獨(dú)特的，因?yàn)樗鼈兛梢栽偕闹?，包括不那么重要的大腦部分。
      

      “為了充分了解再生并找出其在大多數(shù)物種中如此有限的原因，科學(xué)家們需要獲得基因組數(shù)據(jù)來(lái)研究基因調(diào)控和進(jìn)化，”奧地利維也納分子病理學(xué)研究所的Sergej Nowoshilow博士解釋說(shuō)。和共同作者。
      

      “到目前為止，由于其龐大的規(guī)模，蠑螈基因組已經(jīng)避免了完整的裝配 - 在320億堿基對(duì)，它比人類(lèi)基因組大10倍以上。”
      

      “使用現(xiàn)有工具的序列組裝過(guò)程被這個(gè)基因組中大量重復(fù)序列所困擾。”
      

      Nowoshilow博士及其同事是第一個(gè)對(duì)蠑螈基因組進(jìn)行測(cè)序和分析的研究，蠑螈基因組是有史以來(lái)最大的基因組。
      

      作者解釋說(shuō)：“使用PacBio平臺(tái)，一種產(chǎn)生長(zhǎng)讀數(shù)以跨越大型重復(fù)區(qū)域的測(cè)序技術(shù)，總共72.435.954個(gè)讀數(shù)被測(cè)序。”
      

      “對(duì)基因組的分析揭示了幾個(gè)似乎指向動(dòng)物獨(dú)特性的特征，”他們說(shuō)。
      

      “我們發(fā)現(xiàn)僅存在于蠑螈和其他兩棲動(dòng)物物種中的幾種基因在再生肢體組織中表達(dá)。”
      

      “最引人注目的是，一種名為PAX3的基本發(fā)育基因在基因組中完全缺失，其功能已被另一種稱(chēng)為PAX7的基因所接管。”
      

      “這兩種基因在肌肉和神經(jīng)發(fā)育中起著關(guān)鍵作用。”
      

      Nowoshilow博士補(bǔ)充說(shuō)：“我們現(xiàn)在掌握了地圖，以研究腿部等復(fù)雜結(jié)構(gòu)的重建方式。”
      

      “這是使用axolotl的科學(xué)家群體的轉(zhuǎn)折點(diǎn)，這是150多年前開(kāi)始的一項(xiàng)研究冒險(xiǎn)的真正里程碑。”
      
			

			
        
      
			
      
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